Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Hnf4aP49698 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hnf4aP49698 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hnf4aP49698 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hnf4aP49698 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hnf4aP49698 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hnf4aP49698 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Hnf4aP49698 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hnf4aP49698 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Hnf4aP49698 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Hnf4aP49698 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hnf4aP49698 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hnf4aP49698 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Hnf4aP49698 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Hnf4aP49698 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hnf4aP49698 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hnf4aP49698 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hnf4aP49698 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hnf4aP49698 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hnf4aP49698 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hnf4aP49698 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hnf4aP49698 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Hnf4aP49698 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Hnf4aP49698 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hnf4aP49698 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hnf4aP49698 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hnf4aP49698 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hnf4aP49698 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hnf4aP49698 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hnf4aP49698 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hnf4aP49698 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hnf4aP49698 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hnf4aP49698 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hnf4aP49698 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hnf4aP49698 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hnf4aP49698 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hnf4aP49698 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hnf4aP49698 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Hnf4aP49698 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hnf4aP49698 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hnf4aP49698 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hnf4aP49698 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hnf4aP49698 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hnf4aP49698 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Hnf4aP49698 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hnf4aP49698 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hnf4aP49698 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hnf4aP49698 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hnf4aP49698 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hnf4aP49698 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hnf4aP49698 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hnf4aP49698 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hnf4aP49698 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hnf4aP49698 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hnf4aP49698 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hnf4aP49698 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hnf4aP49698 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hnf4aP49698 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hnf4aP49698 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hnf4aP49698 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hnf4aP49698 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hnf4aP49698 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Hnf4aP49698 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hnf4aP49698 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hnf4aP49698 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hnf4aP49698 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hnf4aP49698 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hnf4aP49698 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hnf4aP49698 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hnf4aP49698 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hnf4aP49698 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hnf4aP49698 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hnf4aP49698 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hnf4aP49698 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hnf4aP49698 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hnf4aP49698 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hnf4aP49698 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hnf4aP49698 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hnf4aP49698 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hnf4aP49698 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hnf4aP49698 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hnf4aP49698 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hnf4aP49698 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hnf4aP49698 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hnf4aP49698 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hnf4aP49698 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hnf4aP49698 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hnf4aP49698 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hnf4aP49698 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hnf4aP49698 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hnf4aP49698 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hnf4aP49698 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hnf4aP49698 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hnf4aP49698 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hnf4aP49698 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hnf4aP49698 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hnf4aP49698 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hnf4aP49698 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hnf4aP49698 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hnf4aP49698 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms