Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Kcnab2P62482 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kcnab2P62482 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kcnab2P62482 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kcnab2P62482 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Kcnab2P62482 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Kcnab2P62482 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kcnab2P62482 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Kcnab2P62482 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kcnab2P62482 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kcnab2P62482 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kcnab2P62482 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Kcnab2P62482 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Kcnab2P62482 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kcnab2P62482 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Kcnab2P62482 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kcnab2P62482 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcnab2P62482 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcnab2P62482 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcnab2P62482 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnab2P62482 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcnab2P62482 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kcnab2P62482 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcnab2P62482 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnab2P62482 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcnab2P62482 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcnab2P62482 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcnab2P62482 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcnab2P62482 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcnab2P62482 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnab2P62482 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kcnab2P62482 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnab2P62482 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnab2P62482 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnab2P62482 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnab2P62482 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnab2P62482 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnab2P62482 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnab2P62482 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnab2P62482 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnab2P62482 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnab2P62482 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnab2P62482 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnab2P62482 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kcnab2P62482 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kcnab2P62482 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcnab2P62482 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnab2P62482 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnab2P62482 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnab2P62482 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnab2P62482 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnab2P62482 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnab2P62482 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcnab2P62482 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcnab2P62482 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnab2P62482 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcnab2P62482 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnab2P62482 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnab2P62482 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnab2P62482 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnab2P62482 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnab2P62482 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kcnab2P62482 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnab2P62482 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnab2P62482 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kcnab2P62482 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Kcnab2P62482 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnab2P62482 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnab2P62482 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kcnab2P62482 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnab2P62482 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnab2P62482 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnab2P62482 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnab2P62482 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnab2P62482 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnab2P62482 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnab2P62482 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnab2P62482 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnab2P62482 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnab2P62482 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnab2P62482 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnab2P62482 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcnab2P62482 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcnab2P62482 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnab2P62482 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnab2P62482 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnab2P62482 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnab2P62482 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnab2P62482 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnab2P62482 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnab2P62482 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnab2P62482 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnab2P62482 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnab2P62482 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnab2P62482 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms