Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM5

Sis, Sucrase isomaltase (alpha-glucosidase), mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SisF8VQM5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
SisF8VQM5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SisF8VQM5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SisF8VQM5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
SisF8VQM5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
SisF8VQM5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
SisF8VQM5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SisF8VQM5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SisF8VQM5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SisF8VQM5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SisF8VQM5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
SisF8VQM5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SisF8VQM5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SisF8VQM5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SisF8VQM5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SisF8VQM5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SisF8VQM5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SisF8VQM5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SisF8VQM5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SisF8VQM5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SisF8VQM5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SisF8VQM5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
SisF8VQM5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SisF8VQM5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SisF8VQM5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SisF8VQM5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SisF8VQM5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SisF8VQM5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SisF8VQM5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SisF8VQM5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SisF8VQM5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SisF8VQM5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SisF8VQM5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SisF8VQM5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SisF8VQM5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SisF8VQM5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SisF8VQM5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SisF8VQM5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SisF8VQM5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SisF8VQM5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SisF8VQM5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SisF8VQM5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SisF8VQM5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SisF8VQM5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SisF8VQM5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SisF8VQM5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SisF8VQM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SisF8VQM5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SisF8VQM5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SisF8VQM5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SisF8VQM5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SisF8VQM5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SisF8VQM5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SisF8VQM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SisF8VQM5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SisF8VQM5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SisF8VQM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SisF8VQM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SisF8VQM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SisF8VQM5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SisF8VQM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SisF8VQM5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SisF8VQM5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SisF8VQM5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SisF8VQM5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SisF8VQM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SisF8VQM5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SisF8VQM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SisF8VQM5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SisF8VQM5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SisF8VQM5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SisF8VQM5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SisF8VQM5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SisF8VQM5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SisF8VQM5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SisF8VQM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SisF8VQM5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SisF8VQM5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SisF8VQM5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SisF8VQM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SisF8VQM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SisF8VQM5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SisF8VQM5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SisF8VQM5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SisF8VQM5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SisF8VQM5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SisF8VQM5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SisF8VQM5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SisF8VQM5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SisF8VQM5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SisF8VQM5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SisF8VQM5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SisF8VQM5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SisF8VQM5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SisF8VQM5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SisF8VQM5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SisF8VQM5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SisF8VQM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SisF8VQM5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SisF8VQM5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms