RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554672.5

ATXN3-229, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-229	ENST00000554672	LTF	P02788	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	VDR	P11473	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KRT13	P13646	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	HGF	P14210	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CD19	P15391	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PDC	P20941	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TACR2	P21452	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FPR2	P25090	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	THBS2	P35442	1172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	BLK	P51451	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CCL7	P80098	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	STK4	Q13043	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	C1orf61	Q13536	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RABEP1	Q15276	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KRT39	Q6A163	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ALG14	Q96F25	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MYH11	P35749	1972 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		A0A1W2PQM1	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		D6RAR5	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672		O00370	1275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TOR1B	O14657	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RAD51B	O15315	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TSPAN6	O43657	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	AP1G1	O43747	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	STX10	O60499	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PPP6R2	O75170	966 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	AGFG2	O95081	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FYN	P06241	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CTSL	P07711	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	SLC2A3	P11169	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	TSHR	P16473	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CASP1	P29466	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RGS7	P49802	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	NEK3	P51956	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	THOP1	P52888	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	MAPK10	P53779	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PFN3	P60673	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	YPEL5	P62699	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	KRT83	P78385	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CUL4B	Q13620	913 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	FGL2	Q14314	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	STK38	Q15208	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ELOC	Q15369	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	CNGA2	Q16280	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-229	ENST00000554672	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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