RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgap36B1AUC7 590 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5724L7N264 670 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capns1O88456 269 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01740 135 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gon7P0C8B4 98 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pax3P24610 479 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx1bP61264 288 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcna2P63141 499 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phf12Q5SPL2 1003 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tll1Q62381 1013 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ssx9Q6XAS3 170 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eme1Q8BJW7 570 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf451Q8C0P7 1056 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mamdc2Q8CG85 686 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpne5Q8JZW4 593 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Txndc11Q8K2W3 948 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf8Q8VC56 488 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capn8Q91VA3 703 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfand2bQ91X58 257 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhb13Q91Y06 796 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdha11Q91Y19 950 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Micu3Q9CTY5 523 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fundc2Q9D6K8 151 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cntd1Q9D995 334 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Maged2Q9ER67 616 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss51A0A286YDY8 319 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smim17A0A504 109 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc73B2RWC4 316 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acp4D3YTS9 425 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r24D3YUI0 854 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc9a3G3X939 829 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Top6blJ3QMY9 579 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fcer2P20693 331 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aldh1a1P24549 501 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc30a3P97441 388 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gja5Q01231 358 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q3UJP5 209 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd180Q62192 661 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casc4Q6P2L7 435 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Armc12Q80X86 340 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajb13Q80Y75 316 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6377Q8BHV4 303 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rcor1Q8CFE3 480 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sumf1Q8R0F3 372 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr395Q8VGR3 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndfip2Q91ZP6 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abtb1Q99LJ2 478 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tpgs1Q99MS8 303 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ints11Q9CWS4 600 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc77Q9CZH8 489 aa9.96□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sned1Q70E20 1403 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttll11A4Q9F4 727 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Skint3A7TZF0 458 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17175E9Q528 179 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1121L7MTT1 314 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trdmt1O55055 415 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gucy2eP52785 1108 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RenbpP82343 430 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SctrQ5FWI2 447 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtnr1aQ61184 353 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sox17Q61473 419 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FcgrtQ61559 365 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SvoplQ6PDF3 494 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bend5Q8C6D4 421 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Brd8Q8R3B7 951 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdha8Q91Y12 946 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim12aQ99PQ1 284 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pold3Q9EQ28 462 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt5Q9JKX6 218 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map3k14Q9WUL6 942 aa9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgbd1E9Q492 415 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r57L7N269 863 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map2k3O09110 347 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GclmO09172 274 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sptlc1O35704 473 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il2P04351 169 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mup5P11591 180 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj2P35561 428 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Irf3P70671 419 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc58Q3UGP9 366 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slain1Q68FF7 579 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tex13c3Q810P0 219 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lca5lQ8C0X0 741 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tprg1Q8CB49 279 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IgtpQ9DCE9 423 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Strn3Q9ERG2 796 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.1 ms