Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Pax3P24610 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Pax3P24610 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Pax3P24610 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Pax3P24610 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Pax3P24610 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35■■■■□ 3,19
Pax3P24610 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Pax3P24610 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Pax3P24610 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Pax3P24610 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Pax3P24610 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Pax3P24610 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Pax3P24610 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Pax3P24610 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Pax3P24610 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Pax3P24610 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Pax3P24610 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Pax3P24610 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Pax3P24610 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Pax3P24610 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Pax3P24610 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Pax3P24610 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Pax3P24610 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Pax3P24610 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Pax3P24610 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pax3P24610 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Pax3P24610 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Pax3P24610 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Pax3P24610 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Pax3P24610 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pax3P24610 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Pax3P24610 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Pax3P24610 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pax3P24610 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pax3P24610 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Pax3P24610 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2,71
Pax3P24610 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Pax3P24610 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,9■■■□□ 2,7
Pax3P24610 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pax3P24610 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pax3P24610 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Pax3P24610 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pax3P24610 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Pax3P24610 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Pax3P24610 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Pax3P24610 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pax3P24610 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Pax3P24610 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pax3P24610 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pax3P24610 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pax3P24610 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Pax3P24610 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Pax3P24610 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pax3P24610 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Pax3P24610 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pax3P24610 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pax3P24610 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Pax3P24610 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pax3P24610 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Pax3P24610 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Pax3P24610 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Pax3P24610 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Pax3P24610 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Pax3P24610 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Pax3P24610 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Pax3P24610 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Pax3P24610 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Pax3P24610 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Pax3P24610 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Pax3P24610 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Pax3P24610 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Pax3P24610 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Pax3P24610 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Pax3P24610 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Pax3P24610 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Pax3P24610 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pax3P24610 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pax3P24610 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Pax3P24610 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Pax3P24610 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Pax3P24610 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Pax3P24610 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Pax3P24610 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Pax3P24610 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Pax3P24610 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Pax3P24610 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Pax3P24610 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pax3P24610 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Pax3P24610 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Pax3P24610 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Pax3P24610 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Pax3P24610 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Pax3P24610 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Pax3P24610 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pax3P24610 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pax3P24610 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pax3P24610 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pax3P24610 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Pax3P24610 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Pax3P24610 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,4 ms