Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Tprg1Q8CB49 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tprg1Q8CB49 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tprg1Q8CB49 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tprg1Q8CB49 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tprg1Q8CB49 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tprg1Q8CB49 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Tprg1Q8CB49 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Tprg1Q8CB49 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tprg1Q8CB49 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tprg1Q8CB49 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tprg1Q8CB49 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Tprg1Q8CB49 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tprg1Q8CB49 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tprg1Q8CB49 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tprg1Q8CB49 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tprg1Q8CB49 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Tprg1Q8CB49 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tprg1Q8CB49 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tprg1Q8CB49 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tprg1Q8CB49 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tprg1Q8CB49 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tprg1Q8CB49 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tprg1Q8CB49 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tprg1Q8CB49 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tprg1Q8CB49 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tprg1Q8CB49 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Tprg1Q8CB49 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tprg1Q8CB49 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tprg1Q8CB49 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tprg1Q8CB49 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tprg1Q8CB49 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tprg1Q8CB49 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tprg1Q8CB49 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tprg1Q8CB49 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tprg1Q8CB49 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tprg1Q8CB49 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tprg1Q8CB49 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tprg1Q8CB49 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tprg1Q8CB49 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tprg1Q8CB49 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tprg1Q8CB49 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tprg1Q8CB49 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tprg1Q8CB49 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tprg1Q8CB49 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tprg1Q8CB49 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tprg1Q8CB49 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Tprg1Q8CB49 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tprg1Q8CB49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tprg1Q8CB49 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tprg1Q8CB49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tprg1Q8CB49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tprg1Q8CB49 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tprg1Q8CB49 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tprg1Q8CB49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tprg1Q8CB49 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tprg1Q8CB49 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tprg1Q8CB49 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tprg1Q8CB49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tprg1Q8CB49 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tprg1Q8CB49 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tprg1Q8CB49 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tprg1Q8CB49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tprg1Q8CB49 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tprg1Q8CB49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tprg1Q8CB49 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tprg1Q8CB49 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tprg1Q8CB49 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tprg1Q8CB49 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tprg1Q8CB49 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tprg1Q8CB49 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tprg1Q8CB49 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tprg1Q8CB49 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tprg1Q8CB49 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tprg1Q8CB49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tprg1Q8CB49 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tprg1Q8CB49 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tprg1Q8CB49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tprg1Q8CB49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tprg1Q8CB49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tprg1Q8CB49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tprg1Q8CB49 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tprg1Q8CB49 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tprg1Q8CB49 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tprg1Q8CB49 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tprg1Q8CB49 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tprg1Q8CB49 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tprg1Q8CB49 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tprg1Q8CB49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tprg1Q8CB49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tprg1Q8CB49 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tprg1Q8CB49 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tprg1Q8CB49 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tprg1Q8CB49 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tprg1Q8CB49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tprg1Q8CB49 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tprg1Q8CB49 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tprg1Q8CB49 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tprg1Q8CB49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tprg1Q8CB49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms