Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sox17Q61473 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Sox17Q61473 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sox17Q61473 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox17Q61473 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox17Q61473 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sox17Q61473 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox17Q61473 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox17Q61473 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sox17Q61473 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox17Q61473 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox17Q61473 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sox17Q61473 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sox17Q61473 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox17Q61473 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sox17Q61473 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox17Q61473 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox17Q61473 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox17Q61473 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox17Q61473 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sox17Q61473 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox17Q61473 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox17Q61473 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox17Q61473 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox17Q61473 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox17Q61473 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox17Q61473 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox17Q61473 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox17Q61473 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox17Q61473 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox17Q61473 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox17Q61473 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox17Q61473 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox17Q61473 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sox17Q61473 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox17Q61473 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox17Q61473 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox17Q61473 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox17Q61473 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox17Q61473 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox17Q61473 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sox17Q61473 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox17Q61473 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox17Q61473 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox17Q61473 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox17Q61473 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox17Q61473 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox17Q61473 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox17Q61473 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox17Q61473 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox17Q61473 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox17Q61473 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox17Q61473 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox17Q61473 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox17Q61473 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox17Q61473 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox17Q61473 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox17Q61473 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox17Q61473 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox17Q61473 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox17Q61473 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox17Q61473 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox17Q61473 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox17Q61473 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox17Q61473 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox17Q61473 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox17Q61473 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox17Q61473 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox17Q61473 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox17Q61473 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox17Q61473 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox17Q61473 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox17Q61473 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox17Q61473 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox17Q61473 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox17Q61473 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox17Q61473 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox17Q61473 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox17Q61473 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox17Q61473 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox17Q61473 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox17Q61473 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sox17Q61473 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox17Q61473 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox17Q61473 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox17Q61473 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox17Q61473 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox17Q61473 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox17Q61473 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox17Q61473 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox17Q61473 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox17Q61473 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox17Q61473 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox17Q61473 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox17Q61473 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox17Q61473 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox17Q61473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox17Q61473 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox17Q61473 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox17Q61473 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms