Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX6

Nudt5, ADP-sugar pyrophosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt5Q9JKX6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Nudt5Q9JKX6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Nudt5Q9JKX6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Nudt5Q9JKX6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Nudt5Q9JKX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Nudt5Q9JKX6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Nudt5Q9JKX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Nudt5Q9JKX6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Nudt5Q9JKX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nudt5Q9JKX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Nudt5Q9JKX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nudt5Q9JKX6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nudt5Q9JKX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Nudt5Q9JKX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nudt5Q9JKX6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nudt5Q9JKX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nudt5Q9JKX6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Nudt5Q9JKX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Nudt5Q9JKX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nudt5Q9JKX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nudt5Q9JKX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Nudt5Q9JKX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nudt5Q9JKX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nudt5Q9JKX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nudt5Q9JKX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nudt5Q9JKX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nudt5Q9JKX6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nudt5Q9JKX6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Nudt5Q9JKX6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nudt5Q9JKX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nudt5Q9JKX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Nudt5Q9JKX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Nudt5Q9JKX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nudt5Q9JKX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nudt5Q9JKX6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nudt5Q9JKX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nudt5Q9JKX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Nudt5Q9JKX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nudt5Q9JKX6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nudt5Q9JKX6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nudt5Q9JKX6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nudt5Q9JKX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nudt5Q9JKX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nudt5Q9JKX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nudt5Q9JKX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nudt5Q9JKX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nudt5Q9JKX6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nudt5Q9JKX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Nudt5Q9JKX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nudt5Q9JKX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nudt5Q9JKX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nudt5Q9JKX6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nudt5Q9JKX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nudt5Q9JKX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nudt5Q9JKX6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nudt5Q9JKX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nudt5Q9JKX6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Nudt5Q9JKX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nudt5Q9JKX6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nudt5Q9JKX6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nudt5Q9JKX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nudt5Q9JKX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nudt5Q9JKX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Nudt5Q9JKX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nudt5Q9JKX6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nudt5Q9JKX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nudt5Q9JKX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nudt5Q9JKX6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nudt5Q9JKX6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nudt5Q9JKX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nudt5Q9JKX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nudt5Q9JKX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nudt5Q9JKX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nudt5Q9JKX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nudt5Q9JKX6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Nudt5Q9JKX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nudt5Q9JKX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nudt5Q9JKX6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nudt5Q9JKX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Nudt5Q9JKX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nudt5Q9JKX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nudt5Q9JKX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nudt5Q9JKX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Nudt5Q9JKX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Nudt5Q9JKX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nudt5Q9JKX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nudt5Q9JKX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nudt5Q9JKX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Nudt5Q9JKX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nudt5Q9JKX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Nudt5Q9JKX6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nudt5Q9JKX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nudt5Q9JKX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nudt5Q9JKX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms