Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ssx9Q6XAS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ssx9Q6XAS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ssx9Q6XAS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ssx9Q6XAS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ssx9Q6XAS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ssx9Q6XAS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssx9Q6XAS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ssx9Q6XAS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssx9Q6XAS3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ssx9Q6XAS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ssx9Q6XAS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Ssx9Q6XAS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ssx9Q6XAS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ssx9Q6XAS3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ssx9Q6XAS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ssx9Q6XAS3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Ssx9Q6XAS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ssx9Q6XAS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ssx9Q6XAS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ssx9Q6XAS3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ssx9Q6XAS3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ssx9Q6XAS3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ssx9Q6XAS3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ssx9Q6XAS3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ssx9Q6XAS3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ssx9Q6XAS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ssx9Q6XAS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ssx9Q6XAS3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ssx9Q6XAS3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ssx9Q6XAS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ssx9Q6XAS3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ssx9Q6XAS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ssx9Q6XAS3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ssx9Q6XAS3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ssx9Q6XAS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ssx9Q6XAS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ssx9Q6XAS3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ssx9Q6XAS3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ssx9Q6XAS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ssx9Q6XAS3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ssx9Q6XAS3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssx9Q6XAS3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssx9Q6XAS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssx9Q6XAS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssx9Q6XAS3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssx9Q6XAS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssx9Q6XAS3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ssx9Q6XAS3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ssx9Q6XAS3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssx9Q6XAS3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ssx9Q6XAS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ssx9Q6XAS3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ssx9Q6XAS3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssx9Q6XAS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssx9Q6XAS3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssx9Q6XAS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssx9Q6XAS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssx9Q6XAS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ssx9Q6XAS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssx9Q6XAS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssx9Q6XAS3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssx9Q6XAS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssx9Q6XAS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ssx9Q6XAS3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ssx9Q6XAS3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ssx9Q6XAS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ssx9Q6XAS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ssx9Q6XAS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ssx9Q6XAS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ssx9Q6XAS3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssx9Q6XAS3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssx9Q6XAS3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssx9Q6XAS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssx9Q6XAS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssx9Q6XAS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssx9Q6XAS3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssx9Q6XAS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssx9Q6XAS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssx9Q6XAS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssx9Q6XAS3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssx9Q6XAS3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssx9Q6XAS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssx9Q6XAS3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssx9Q6XAS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ssx9Q6XAS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ssx9Q6XAS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssx9Q6XAS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssx9Q6XAS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssx9Q6XAS3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ssx9Q6XAS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ssx9Q6XAS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ssx9Q6XAS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ssx9Q6XAS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ssx9Q6XAS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssx9Q6XAS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssx9Q6XAS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms