Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Capns1O88456 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Capns1O88456 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Capns1O88456 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Capns1O88456 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Capns1O88456 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Capns1O88456 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Capns1O88456 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Capns1O88456 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Capns1O88456 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capns1O88456 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Capns1O88456 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capns1O88456 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Capns1O88456 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capns1O88456 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capns1O88456 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capns1O88456 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capns1O88456 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Capns1O88456 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capns1O88456 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Capns1O88456 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capns1O88456 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capns1O88456 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Capns1O88456 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Capns1O88456 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capns1O88456 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capns1O88456 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Capns1O88456 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Capns1O88456 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capns1O88456 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capns1O88456 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Capns1O88456 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Capns1O88456 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Capns1O88456 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capns1O88456 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capns1O88456 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capns1O88456 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Capns1O88456 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capns1O88456 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capns1O88456 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capns1O88456 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capns1O88456 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capns1O88456 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capns1O88456 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Capns1O88456 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capns1O88456 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Capns1O88456 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capns1O88456 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capns1O88456 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Capns1O88456 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capns1O88456 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capns1O88456 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capns1O88456 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capns1O88456 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capns1O88456 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capns1O88456 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capns1O88456 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capns1O88456 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capns1O88456 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capns1O88456 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capns1O88456 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capns1O88456 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capns1O88456 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capns1O88456 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capns1O88456 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capns1O88456 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capns1O88456 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Capns1O88456 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capns1O88456 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Capns1O88456 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capns1O88456 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Capns1O88456 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capns1O88456 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capns1O88456 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capns1O88456 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capns1O88456 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capns1O88456 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Capns1O88456 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capns1O88456 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capns1O88456 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capns1O88456 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capns1O88456 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Capns1O88456 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capns1O88456 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capns1O88456 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capns1O88456 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns1O88456 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns1O88456 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capns1O88456 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capns1O88456 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capns1O88456 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capns1O88456 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capns1O88456 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capns1O88456 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capns1O88456 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capns1O88456 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns1O88456 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns1O88456 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capns1O88456 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capns1O88456 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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