Protein–RNA interactions for Protein: P82343

Renbp, N-acylglucosamine 2-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RenbpP82343 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
RenbpP82343 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RenbpP82343 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RenbpP82343 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RenbpP82343 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RenbpP82343 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RenbpP82343 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RenbpP82343 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
RenbpP82343 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RenbpP82343 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RenbpP82343 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RenbpP82343 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RenbpP82343 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RenbpP82343 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RenbpP82343 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RenbpP82343 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RenbpP82343 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RenbpP82343 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RenbpP82343 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RenbpP82343 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RenbpP82343 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RenbpP82343 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RenbpP82343 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RenbpP82343 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
RenbpP82343 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RenbpP82343 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RenbpP82343 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RenbpP82343 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RenbpP82343 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RenbpP82343 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RenbpP82343 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RenbpP82343 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RenbpP82343 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RenbpP82343 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RenbpP82343 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RenbpP82343 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RenbpP82343 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RenbpP82343 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RenbpP82343 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RenbpP82343 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RenbpP82343 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RenbpP82343 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RenbpP82343 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RenbpP82343 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RenbpP82343 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RenbpP82343 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RenbpP82343 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RenbpP82343 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RenbpP82343 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RenbpP82343 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RenbpP82343 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RenbpP82343 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RenbpP82343 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RenbpP82343 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RenbpP82343 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RenbpP82343 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RenbpP82343 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RenbpP82343 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RenbpP82343 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RenbpP82343 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RenbpP82343 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RenbpP82343 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RenbpP82343 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RenbpP82343 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
RenbpP82343 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RenbpP82343 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
RenbpP82343 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RenbpP82343 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RenbpP82343 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RenbpP82343 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RenbpP82343 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RenbpP82343 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RenbpP82343 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RenbpP82343 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RenbpP82343 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RenbpP82343 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RenbpP82343 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RenbpP82343 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RenbpP82343 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RenbpP82343 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RenbpP82343 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RenbpP82343 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RenbpP82343 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RenbpP82343 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RenbpP82343 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RenbpP82343 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RenbpP82343 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RenbpP82343 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RenbpP82343 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RenbpP82343 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RenbpP82343 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RenbpP82343 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RenbpP82343 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RenbpP82343 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RenbpP82343 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RenbpP82343 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RenbpP82343 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RenbpP82343 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RenbpP82343 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RenbpP82343 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms