Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Cpne5Q8JZW4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cpne5Q8JZW4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cpne5Q8JZW4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cpne5Q8JZW4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cpne5Q8JZW4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cpne5Q8JZW4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpne5Q8JZW4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpne5Q8JZW4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cpne5Q8JZW4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpne5Q8JZW4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpne5Q8JZW4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpne5Q8JZW4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpne5Q8JZW4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpne5Q8JZW4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpne5Q8JZW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cpne5Q8JZW4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cpne5Q8JZW4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpne5Q8JZW4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpne5Q8JZW4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpne5Q8JZW4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpne5Q8JZW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpne5Q8JZW4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpne5Q8JZW4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpne5Q8JZW4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpne5Q8JZW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpne5Q8JZW4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpne5Q8JZW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpne5Q8JZW4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cpne5Q8JZW4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpne5Q8JZW4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpne5Q8JZW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cpne5Q8JZW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cpne5Q8JZW4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cpne5Q8JZW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpne5Q8JZW4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpne5Q8JZW4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpne5Q8JZW4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cpne5Q8JZW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cpne5Q8JZW4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cpne5Q8JZW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cpne5Q8JZW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpne5Q8JZW4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne5Q8JZW4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne5Q8JZW4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpne5Q8JZW4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne5Q8JZW4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpne5Q8JZW4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpne5Q8JZW4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpne5Q8JZW4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpne5Q8JZW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpne5Q8JZW4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpne5Q8JZW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpne5Q8JZW4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne5Q8JZW4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpne5Q8JZW4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpne5Q8JZW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpne5Q8JZW4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpne5Q8JZW4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpne5Q8JZW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne5Q8JZW4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne5Q8JZW4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpne5Q8JZW4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpne5Q8JZW4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpne5Q8JZW4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpne5Q8JZW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpne5Q8JZW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne5Q8JZW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpne5Q8JZW4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpne5Q8JZW4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpne5Q8JZW4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpne5Q8JZW4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpne5Q8JZW4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpne5Q8JZW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpne5Q8JZW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpne5Q8JZW4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpne5Q8JZW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpne5Q8JZW4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cpne5Q8JZW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cpne5Q8JZW4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne5Q8JZW4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne5Q8JZW4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpne5Q8JZW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpne5Q8JZW4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne5Q8JZW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne5Q8JZW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpne5Q8JZW4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cpne5Q8JZW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cpne5Q8JZW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne5Q8JZW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne5Q8JZW4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpne5Q8JZW4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne5Q8JZW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne5Q8JZW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne5Q8JZW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne5Q8JZW4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne5Q8JZW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms