Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Trim12aQ99PQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Trim12aQ99PQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim12aQ99PQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim12aQ99PQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Trim12aQ99PQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trim12aQ99PQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Trim12aQ99PQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim12aQ99PQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim12aQ99PQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trim12aQ99PQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim12aQ99PQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Trim12aQ99PQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trim12aQ99PQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Trim12aQ99PQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Trim12aQ99PQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim12aQ99PQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trim12aQ99PQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trim12aQ99PQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trim12aQ99PQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trim12aQ99PQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Trim12aQ99PQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Trim12aQ99PQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trim12aQ99PQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim12aQ99PQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim12aQ99PQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim12aQ99PQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trim12aQ99PQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Trim12aQ99PQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Trim12aQ99PQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trim12aQ99PQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trim12aQ99PQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trim12aQ99PQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trim12aQ99PQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim12aQ99PQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trim12aQ99PQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Trim12aQ99PQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trim12aQ99PQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trim12aQ99PQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trim12aQ99PQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim12aQ99PQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim12aQ99PQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim12aQ99PQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim12aQ99PQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim12aQ99PQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim12aQ99PQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim12aQ99PQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim12aQ99PQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim12aQ99PQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim12aQ99PQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim12aQ99PQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim12aQ99PQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim12aQ99PQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim12aQ99PQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim12aQ99PQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim12aQ99PQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim12aQ99PQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trim12aQ99PQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim12aQ99PQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim12aQ99PQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim12aQ99PQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim12aQ99PQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim12aQ99PQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim12aQ99PQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim12aQ99PQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim12aQ99PQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim12aQ99PQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim12aQ99PQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim12aQ99PQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim12aQ99PQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim12aQ99PQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Trim12aQ99PQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim12aQ99PQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim12aQ99PQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim12aQ99PQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim12aQ99PQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim12aQ99PQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim12aQ99PQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim12aQ99PQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim12aQ99PQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim12aQ99PQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim12aQ99PQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim12aQ99PQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim12aQ99PQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim12aQ99PQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim12aQ99PQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim12aQ99PQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim12aQ99PQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim12aQ99PQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim12aQ99PQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim12aQ99PQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim12aQ99PQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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