Protein–RNA interactions for Protein: A0A504

Smim17, MCG116182, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim17A0A504 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Smim17A0A504 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Smim17A0A504 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Smim17A0A504 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Smim17A0A504 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Smim17A0A504 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Smim17A0A504 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Smim17A0A504 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Smim17A0A504 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Smim17A0A504 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Smim17A0A504 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Smim17A0A504 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Smim17A0A504 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Smim17A0A504 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Smim17A0A504 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Smim17A0A504 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Smim17A0A504 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Smim17A0A504 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Smim17A0A504 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Smim17A0A504 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Smim17A0A504 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Smim17A0A504 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Smim17A0A504 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Smim17A0A504 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Smim17A0A504 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Smim17A0A504 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Smim17A0A504 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Smim17A0A504 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Smim17A0A504 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Smim17A0A504 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Smim17A0A504 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Smim17A0A504 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Smim17A0A504 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Smim17A0A504 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Smim17A0A504 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Smim17A0A504 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Smim17A0A504 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Smim17A0A504 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smim17A0A504 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smim17A0A504 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Smim17A0A504 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smim17A0A504 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smim17A0A504 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smim17A0A504 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smim17A0A504 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smim17A0A504 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smim17A0A504 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Smim17A0A504 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Smim17A0A504 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Smim17A0A504 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Smim17A0A504 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Smim17A0A504 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Smim17A0A504 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Smim17A0A504 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Smim17A0A504 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Smim17A0A504 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Smim17A0A504 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Smim17A0A504 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Smim17A0A504 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Smim17A0A504 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Smim17A0A504 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Smim17A0A504 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Smim17A0A504 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Smim17A0A504 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Smim17A0A504 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Smim17A0A504 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Smim17A0A504 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Smim17A0A504 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Smim17A0A504 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Smim17A0A504 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Smim17A0A504 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Smim17A0A504 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Smim17A0A504 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Smim17A0A504 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Smim17A0A504 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Smim17A0A504 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Smim17A0A504 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Smim17A0A504 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Smim17A0A504 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Smim17A0A504 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Smim17A0A504 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Smim17A0A504 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Smim17A0A504 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Smim17A0A504 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Smim17A0A504 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Smim17A0A504 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Smim17A0A504 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Smim17A0A504 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Smim17A0A504 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Smim17A0A504 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Smim17A0A504 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Smim17A0A504 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Smim17A0A504 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Smim17A0A504 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Smim17A0A504 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
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