RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 M0QYT0 321 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CCNA2P20248 432 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 SLC1A2P43004 574 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 DNAJB13P59910 316 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 POU6F1Q14863 301 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CSF3RQ99062 836 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 KIFC1Q9BW19 673 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 NANOGQ9H9S0 305 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 MAGEB16A2A368 324 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 FXYD1O00168 92 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 ELK4P28324 431 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CAPGP40121 348 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 SNX16P57768 344 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0D1P61421 351 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.58■□□□□ 0.89
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PMS1-222ENST00000639501 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 SGCDQ92629 289 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 MYRFLQ96LU7 910 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 FANCEQ9HB96 536 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 CMTM6Q9NX76 183 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 GJD2Q9UKL4 321 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-222ENST00000639501 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CPNE6O95741 557 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GSTT2P0CG29 244 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GSTT2BP0CG30 244 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CAPN3P20807 821 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GPX3P22352 226 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 EDNRBP24530 442 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DDIASQ8IXT1 998 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 COPS5Q92905 334 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ARPC2O15144 300 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 VTNP04004 478 aa20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-222ENST00000639501 IDUAP35475 653 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NDUFV1P49821 464 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-222ENST00000639501 PSMD5Q16401 504 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 USP33Q8TEY7 942 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SNX19Q92543 992 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 GID8Q9NWU2 228 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 KRBA1A5PL33 1030 aa20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-222ENST00000639501 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-222ENST00000639501 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TERB1Q8NA31 727 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PALMDQ9NP74 551 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 A0A0J9YYE9 177 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 C22orf31O95567 290 aa20.56■□□□□ 0.88
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PMS1-222ENST00000639501 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 HLCSP50747 726 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PYCR3Q53H96 274 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 LCN8Q6JVE9 175 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TBPL2Q6SJ96 375 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TAMM41Q96BW9 452 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NPY6RQ99463 290 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.56■□□□□ 0.88
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