RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W FKS3Q04952 1785 aa3.29□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W MTO1P53070 669 aa3.29□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W TY4B-JP47024 1803 aa3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W EDE1P34216 1381 aa3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W SRS2P12954 1174 aa3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W MRPL33P20084 86 aa3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W ALD4P46367 519 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W NCL1P38205 684 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YBR197CP38306 217 aa3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W PSK1P31374 1356 aa3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W RAD9P14737 1309 aa3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W APM2P38700 605 aa3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W QDR2P40474 542 aa3.27□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YRF1-6P53819 1859 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W DYS1P38791 387 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YML083CQ04526 418 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YOR296WQ08748 1289 aa3.26□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W VMA3P25515 160 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W PRK1P40494 810 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W BUD9P53226 547 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W PUN1Q06991 263 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W ISC10P32645 267 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W TAF5P38129 798 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W APC11Q12157 165 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W TOM1Q03280 3268 aa3.25□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W SNF2P22082 1703 aa3.24□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W LDH1P38139 375 aa3.24□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W IDI1P15496 288 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W GIP1P38229 639 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YJL181WP46987 611 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W ITC1P53125 1264 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W PNP1Q05788 311 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W ISW1P38144 1129 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YNR040WP53736 256 aa3.23□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YKR075CP36155 307 aa3.22□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W BSD2P38356 321 aa3.22□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W GIS4Q04233 774 aa3.22□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W SLP1Q12232 587 aa3.22□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W LSO1Q3E827 93 aa3.22□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.21□□□□□ -1.89not detected
SSQ1YLR369W RRN6P32786 894 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W KTR2P33550 425 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W YBR287WP38355 427 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W EAF6P47128 113 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W RSC2Q06488 889 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W NHA1Q99271 985 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W RSF2P46974 1380 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W RAV1P47104 1357 aa3.21□□□□□ -1.89
SSQ1YLR369W COBP00163 385 aa3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W MSN1P22148 382 aa3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W PRP40P33203 583 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W ALG14P38242 237 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YIL165CP40446 119 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W HXT8P40886 569 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W NTA1P40354 457 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RCM1P53972 490 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W AOS1Q06624 347 aa3.2□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W TRP3P00937 484 aa3.19□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W PPH3P32345 308 aa3.19□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YKR073CP36153 106 aa3.19□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W BOL3P39724 118 aa3.19□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W GAS5Q08193 484 aa3.19□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W MRP10O75012 95 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W AI3P03877 415 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SMC1P32908 1225 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YKL133CP36066 463 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W FIR1P40020 876 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RGD2P43556 714 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W MED7Q08278 222 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YIL177CP40434 1758 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YJL225CP40889 1758 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RPB10P22139 70 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W LIP5P32875 414 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W PPT1P53043 513 aa3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W RTC1Q08281 1341 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W YRF1-4O13559 1382 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SAC7P17121 654 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W SFA1P32771 386 aa3.17□□□□□ -1.9
SSQ1YLR369W ATG1P53104 897 aa3.17□□□□□ -1.9
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