RNA–Protein interactions for RNA: YKL069W

YKL069W, Transcript of Methionine-R-sulfoxide reductase, yeast

Gene YKL069W, Length 543 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL069W	YKL069W	GIP2	P40036	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	PEX13	P80667	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	DUT1	P33317	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	RDH54	P38086	958 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	PAN5	P38787	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	XKS1	P42826	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ENT3	P47160	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	GNP1	P48813	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	NHA1	Q99271	985 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	GCR1	P07261	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	VAC8	P39968	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TED1	P40533	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	GCV1	P48015	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	MRL1	Q06815	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SAC7	P17121	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	NNF1	P47149	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SIW14	P53965	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	MEC3	Q02574	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	HDA2	Q06629	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YKL069W	YKL069W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	RAD27	P26793	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	OCA5	P38738	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	NEM1	P38757	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	CWC24	P53769	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ELG1	Q12050	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	AI1	P03875	834 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	HXT13	P39924	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YGR053C	P53234	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	HXT17	P53631	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	FAR11	P53917	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	HXT15	P54854	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	TRK2	P28584	889 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	SLS1	P42900	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	DSE4	P53753	1117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	EEB1	Q02891	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	RKM2	Q03942	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	REC8	Q12188	680 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YTA7	P40340	1379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	ERS1	P17261	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	ADD66	P36040	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	BOI2	P39969	1040 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YJL049W	P47048	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	EST2	Q06163	884 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	RRM3	P38766	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YNR014W	P53719	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	ROD1	Q02805	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	LYP1	P32487	611 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	MKK2	P32491	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	SFA1	P32771	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	RER2	P35196	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	ATG14	P38270	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
YKL069W	YKL069W	OPI10	Q08202	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YAR028W	P39548	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YFL066C	P43538	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL069W	YKL069W	AIM44	Q99299	758 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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