RNA–Protein interactions for RNA: YFR008W

FAR7, Transcript of Protein involved in recovery from pheromone-induced cell cycle arrest, yeast

Gene FAR7, Length 666 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAR7	YFR008W	FAR11	P53917	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	ELG1	Q12050	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	RSC6	P25632	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	SFA1	P32771	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	SEC8	P32855	1065 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	OMA1	P36163	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	ULP1	Q02724	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	TOS4	Q06266	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	MCM2	P29469	868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	IRC24	P40580	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	RSM26	P47141	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	YJR107W	P47145	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	PEX13	P80667	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	ERS1	P17261	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	SQT1	P35184	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	FAA3	P39002	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	MRPS18	P42847	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	YGR122W	P53272	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	YIG1	Q08956	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAR7	YFR008W	PEP7	P32609	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	GCV1	P48015	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	MEC3	Q02574	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	ADI1	Q03677	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	MSH3	P25336	1018 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	PEX28	P38848	579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	RAD2	P07276	1031 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	CYC8	P14922	966 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	EXO5	P38289	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	NCE103	P53615	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	SPR28	Q04921	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	MCD1	Q12158	566 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	FYV10	P40492	516 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	SLS1	P42900	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	ATG14	P38270	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	REC8	Q12188	680 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	COQ2	P32378	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	PIC2	P40035	300 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAR7	YFR008W	GPT2	P36148	743 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	NEM1	P38757	446 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	AKR1	P39010	764 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	YGR045C	P53229	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	GIC2	Q06648	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	KAE1	P36132	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	AVT1	P47082	602 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	YNR063W	P53749	607 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	RMD1	Q03441	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	TRP3	P00937	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	YKR073C	P36153	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	SAF1	P38352	637 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	XKS1	P42826	600 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	SPO74	P45819	413 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
FAR7	YFR008W	MED7	Q08278	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	LAP2	Q10740	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	CHS2	P14180	963 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	ADD66	P36040	267 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	RDH54	P38086	958 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAR7	YFR008W	YAR028W	P39548	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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