RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	SAP155	P43612	1002 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CLA4	P48562	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PEX13	P80667	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	AGP1	P25376	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SLA1	P32790	1244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	AAD14	P42884	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PFD1	P46988	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PMT7	Q06644	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ADR1	P07248	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ARE1	P25628	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RER2	P35196	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HXT13	P39924	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RTA1	P53047	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HXT17	P53631	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HXT15	P54854	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	EAF1	Q06337	982 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	NTG2	Q08214	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	REC8	Q12188	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	UGA3	P26370	528 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RIM11	P38615	370 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	TPM2	P40414	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	IRR1	P40541	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SHE9	Q04172	456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SPO20	Q04359	397 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MSH3	P25336	1018 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	DLD1	P32891	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MRP8	P35719	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	YNR040W	P53736	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ARG82	P07250	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TPD3	YAL016W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TPD3	YAL016W	MSH2	P25847	964 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SKP1	P52286	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ERP6	P53198	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	TAF8	Q03750	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	NPR1	P22211	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	GRX7	P38068	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SIW14	P53965	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ROD1	Q02805	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	RGP1	P16664	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	BET3	P36149	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	APM2	P38700	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
TPD3	YAL016W	FOL1	P53848	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	INO1	P11986	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	DAL1	P32375	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	PBY1	P38254	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	HUL4	P40985	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ALR2	P43553	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	PPT1	P53043	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	TAF13	P11747	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	SFP1	P32432	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	RDH54	P38086	958 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	TFB2	Q02939	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ATG13	Q06628	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	BCK2	P33306	851 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MBP1	P39678	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	GLO4	Q12320	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	MAL11	P53048	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPD3	YAL016W	FUS1	P11710	512 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	AMS1	P22855	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	MKK2	P32491	506 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	ASH1	P34233	588 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	EXO5	P38289	585 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	YJL181W	P46987	611 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	VTC4	P47075	721 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	VPS72	Q03388	795 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	IDI1	P15496	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	AFT1	P22149	690 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPD3	YAL016W	SEC6	P32844	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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