RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379108.1

KCTD4-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene KCTD4, Length 1,865 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4-201ENST00000379108 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 SOX12O15370 315 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.3□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 GRIN2BQ13224 1484 aa9.29□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 EVA1CP58658 441 aa9.29□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.29□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 CCDC189A1A4V9 331 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 TINF2Q9BSI4 451 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 ADAMTS12P58397 1594 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.28□□□□□ -0.92
KCTD4-201ENST00000379108 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.26□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.26□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 DPYSL4O14531 572 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ATP2B1P20020 1258 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SSFA2P28290 1259 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SCYL1Q96KG9 808 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SERPINB4P48594 390 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 HIC1Q14526 733 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 UCN2Q96RP3 112 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 JADE2Q9NQC1 790 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ERBB3P21860 1342 aa9.25□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 PDIA6Q15084 440 aa9.24□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 DOK7Q18PE1 504 aa9.24□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TMC2Q8TDI7 906 aa9.24□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 IFT57Q9NWB7 429 aa9.24□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ANP32CO43423 234 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 PTGER2P43116 358 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SYNJ2O15056 1496 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CFAP69A5D8W1 941 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CXorf38Q8TB03 319 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SPC25Q9HBM1 224 aa9.23□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CUL7Q14999 1698 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 RIMBP2O15034 1052 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ZNF280DQ6N043 979 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 KIF27Q86VH2 1401 aa9.22□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.21□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 SWAP70Q9UH65 585 aa9.21□□□□□ -0.93
KCTD4-201ENST00000379108 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 STK32AQ8WU08 396 aa9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 HSD3B2P26439 372 aa9.2□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.2□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 ARMC5Q96C12 935 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 GRIN2AQ12879 1464 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.19□□□□□ -0.94
KCTD4-201ENST00000379108 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms