RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slit2Q9R1B9 1521 aa31,83■■■□□ 2,69
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Ciz1Q8VEH2 845 aa31,83■■■□□ 2,69
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa31,46■■■□□ 2,63
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Slit1Q80TR4 1531 aa31,41■■■□□ 2,62
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp16Q99LG0 825 aa31,41■■■□□ 2,62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ggnbp2Q5SV77 696 aa31,4■■■□□ 2,62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa31,4■■■□□ 2,62
Odc1-201ENSMUST00000171737 RgmbQ7TQ33 436 aa31,39■■■□□ 2,62
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Tnks1bp1P58871 1720 aa31,36■■■□□ 2,61
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf526Q8BI66 675 aa31,35■■■□□ 2,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm6268A2A3U9 297 aa31,33■■■□□ 2,61
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP31,33■■■□□ 2,61
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Aox2Q5SGK3 1345 aa31,33■■■□□ 2,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hspa1lP16627 641 aa31,32■■■□□ 2,6
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