RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Vars2Q3U2A8 1060 aa23.45■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrit1Q8K099 624 aa23.45■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmem132eQ6IEE6 982 aa23.44■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Akap11E9Q777 1895 aa23.43■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mst1rQ62190 1378 aa23.42■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.42■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nwd2Q6P5U7 1742 aa23.42■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sik1Q60670 779 aa23.41■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zranb3Q6NZP1 1069 aa23.41■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 FancaQ9JL70 1439 aa23.41■■□□□ 1.34
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc4a1apE9PX68 744 aa23.39■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 TkfcQ8VC30 578 aa23.39■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa23.39■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Birc3O08863 600 aa23.37■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Snapc4Q8BP86 1333 aa23.36■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa23.36■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slit1Q80TR4 1531 aa23.36■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nsd3Q6P2L6 1439 aa23.34■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pim2Q62070 370 aa23.34■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam184bQ0KK56 942 aa23.33■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Bsdc1Q80Y55 427 aa23.33■■□□□ 1.33
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ubr1O70481 1757 aa23.32■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kcnh4A2A5F7 1018 aa23.32■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hoxc9P09633 260 aa23.32■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa23.31■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arhgap33Q80YF9 1305 aa23.31■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ciz1Q8VEH2 845 aa23.3■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mdc1Q5PSV9 1707 aa23.3■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PsdQ5DTT2 1024 aa23.29■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gpr150Q8BL07 427 aa23.29■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Q8BT18 775 aa23.29■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Erbb3Q61526 1339 aa23.29■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm10471E9Q1C7 252 aa23.28■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 En2P09066 324 aa23.28■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Magea1O89006 320 aa23.27■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Magea5O89009 320 aa23.27■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Magea2Q9R2A2 320 aa23.27■■□□□ 1.32
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hoxb7P09024 217 aa23.25■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Scn7aB1AYL1 1681 aa23.25■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Map2P20357 1828 aa23.24■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccne1Q61457 408 aa23.24■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ankrd13dQ6PD24 605 aa23.24■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam50bQ9WTJ8 334 aa23.24■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col15a1O35206 1367 aa23.24■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rad17Q6NXW6 688 aa23.22■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Aplp2Q06335 707 aa23.21■■□□□ 1.31
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa23.2■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmf1B9EKI3 1091 aa23.2■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pnpla7A2AJ88 1352 aa23.18■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 FocadA2AKG8 1798 aa23.17■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dcaf11Q91VU6 549 aa23.16■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Speer4bQ9D9F7 267 aa23.16■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif23E9Q5G3 953 aa23.15■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pank3Q8R2W9 370 aa23.15■■□□□ 1.3
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa23.14■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa23.12■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sos2Q02384 1333 aa23.11■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ThemisQ8BGW0 636 aa23.1■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Inpp5dQ9ES52 1191 aa23.1■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kcnq2Q9Z351 759 aa23.1■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PrxO55103 1391 aa23.1■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kcna3P16390 528 aa23.09■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NefmP08553 848 aa23.08■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trpc5Q9QX29 975 aa23.08■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Simc1E9Q6E9 1354 aa23.08■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ptpn23Q6PB44 1692 aa23.08■■□□□ 1.29
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa23.07■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ubxn2bQ0KL01 331 aa23.07■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa23.07■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kdm6aO70546 1401 aa23.07■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ApobrQ8VBT6 942 aa23.06■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Klc3Q91W40 508 aa23.06■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Akt1s1Q9D1F4 257 aa23.05■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam198bQ3UPI1 517 aa23.04■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa23.04■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 IncenpQ9WU62 880 aa23.03■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arfgef2A2A5R2 1792 aa23.02■■□□□ 1.28
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fchsd2Q3USJ8 740 aa23.01■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eya1P97767 591 aa23■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ClspnQ80YR7 1315 aa23■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Egfem1Q8C088 590 aa22.99■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eif4a2P10630 407 aa22.97■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 AtrnQ9WU60 1428 aa22.97■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zscan10Q3URR7 782 aa22.96■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Parp14Q2EMV9 1817 aa22.96■■□□□ 1.27
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.8 ms