RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mcm10Q0VBD2 885 aa24.57■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gimap5Q8BWF2 308 aa24.57■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zmym3Q9JLM4 1370 aa24.57■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 L3mbtl2P59178 703 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ecm2Q5FW85 670 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atp10bB1AWN4 1474 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttll13A4Q9F6 804 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Eya1P97767 591 aa24.56■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kank1E9Q238 1360 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cadps2Q8BYR5 1297 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Stk31Q99MW1 1018 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Iqcf3Q9D498 203 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ptpn23Q6PB44 1692 aa24.55■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plin1Q8CGN5 517 aa24.54■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Bcl11bQ99PV8 884 aa24.54■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atxn3Q9CVD2 355 aa24.54■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca15E9PWH4 1668 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TnikP83510 1323 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm21698A0A087WQP8 267 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm21671G3UY31 267 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Swt1Q9DBQ9 907 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nid2O88322 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Bcl9lQ67FY2 1494 aa24.51■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cabp2Q9JLK4 216 aa24.51■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Slit2Q9R1B9 1521 aa24.49■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plekhh1Q80TI1 1356 aa24.49■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Erbb3Q61526 1339 aa24.48■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm6aO70546 1401 aa24.48■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Card10P58660 1021 aa24.47■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttc41Q692V3 1318 aa24.47■■□□□ 1.51
Cnn3-201ENSMUST00000029773 HdgfP51859 237 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa24.45■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 ZgpatQ8VDM1 511 aa24.45■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Amotl2Q8K371 772 aa24.44■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CenpbP27790 599 aa24.43■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa24.41■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Acsbg1Q99PU5 721 aa24.41■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 HypkQ9CR41 129 aa24.41■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ksr2Q3UVC0 959 aa24.4■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gas2l2Q5SSG4 860 aa24.4■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tom1O88746 492 aa24.4■■□□□ 1.5
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Hspa1lP16627 641 aa24.39■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TkfcQ8VC30 578 aa24.39■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa24.37■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 OptnQ8K3K8 584 aa24.37■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Txnrd1Q9JMH6 613 aa24.37■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ankrd50F7BE84 1390 aa24.36■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa24.36■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Trpm3Q5F4S9 1721 aa24.36■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CrklP47941 303 aa24.35■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zfp142G5E869 1843 aa24.34■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rwdd1Q9CQK7 243 aa24.34■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Col15a1O35206 1367 aa24.33■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NudcO35685 332 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smim5Q8BT42 78 aa24.33■■□□□ 1.49
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arfgef2A2A5R2 1792 aa24.33■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Simc1E9Q6E9 1354 aa24.32■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gnai1B2RSH2 354 aa24.32■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa24.32■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gnai3Q9DC51 354 aa24.32■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10471E9Q1C7 252 aa24.32■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Qtrt2B8ZXI1 415 aa24.31■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa24.31■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Amotl1Q9D4H4 968 aa24.3■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Polr3glQ8R0C0 218 aa24.28■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 RgmbQ7TQ33 436 aa24.28■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Znf526Q8BI66 675 aa24.28■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Trim26Q99PN3 545 aa24.28■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Slit1Q80TR4 1531 aa24.28■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CastP51125 788 aa24.27■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Slx1bQ8BX32 270 aa24.27■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zranb3Q6NZP1 1069 aa24.27■■□□□ 1.48
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plekhd1B2RPU2 505 aa24.26■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 FocadA2AKG8 1798 aa24.25■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sos1Q62245 1319 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Snap23O09044 210 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rtl5Q5DTT4 599 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Anp32aO35381 247 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pak3Q61036 559 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Apbb1Q9QXJ1 710 aa24.23■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Usp16Q99LG0 825 aa24.22■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Cnn3-201ENSMUST00000029773 ThemisQ8BGW0 636 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms