RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NischQ80TM9 1593 aa39.68■■■■□ 3.94
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abcc8B2RUS7 1588 aa38.03■■■■□ 3.68
Cnn3-201ENSMUST00000029773 ScribQ80U72 1612 aa36.05■■■■□ 3.36
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rhox8Q6VSS7 320 aa35.39■■■■□ 3.26
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dcaf1Q80TR8 1506 aa35.3■■■■□ 3.24
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm5dQ62240 1548 aa35.14■■■■□ 3.22
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NacadQ5SWP3 1504 aa35.06■■■■□ 3.2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa34.67■■■■□ 3.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sycp2Q9CUU3 1500 aa34.32■■■■□ 3.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccdc180J3QNE4 1664 aa34.32■■■■□ 3.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Baz1aO88379 1555 aa34.25■■■■□ 3.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Crybg2B7ZCC2 1516 aa33.92■■■■□ 3.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rtl1Q7M732 1744 aa33.88■■■■□ 3.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 BicraF8VPZ9 1578 aa33.67■■■□□ 2.98
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smarca2Q6DIC0 1577 aa33.35■■■□□ 2.93
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa32.94■■■□□ 2.86
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa32.82■■■□□ 2.84
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Synj1Q8CHC4 1574 aa32.32■■■□□ 2.76
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CftrP26361 1476 aa32.27■■■□□ 2.76
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa32.27■■■□□ 2.76
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.82■■■□□ 2.68
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Golga3P55937 1487 aa31.72■■■□□ 2.67
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cngb1E1AZ71 1325 aa31.66■■■□□ 2.66
Cnn3-201ENSMUST00000029773 HrcG5E8J6 738 aa31.56■■■□□ 2.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Top2bQ64511 1612 aa31.53■■■□□ 2.64
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31.41■■■□□ 2.62
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Unc13aQ4KUS2 1712 aa31.37■■■□□ 2.61
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fam135aQ6NS59 1506 aa31.34■■■□□ 2.61
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.24■■■□□ 2.59
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fmn1Q05860 1466 aa31.15■■■□□ 2.58
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa31.15■■■□□ 2.58
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lamc3Q9R0B6 1581 aa31.08■■■□□ 2.57
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cep164Q5DU05 1446 aa31.07■■■□□ 2.57
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chic1Q8CBW7 227 aa31.07■■■□□ 2.56
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ubl4bQ9CQ84 188 aa31.06■■■□□ 2.56
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TnnQ80Z71 1560 aa31.04■■■□□ 2.56
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kif15Q6P9L6 1387 aa31.03■■■□□ 2.56
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.97■■■□□ 2.55
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cux2P70298 1426 aa30.77■■■□□ 2.52
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Grin2bQ01097 1482 aa30.35■■■□□ 2.45
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa30.28■■■□□ 2.44
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kif21aQ9QXL2 1672 aa30.28■■■□□ 2.44
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NrkQ9R0G8 1455 aa30.27■■■□□ 2.44
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Shroom4Q1W617 1475 aa30.18■■■□□ 2.42
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Npm2Q80W85 207 aa30.17■■■□□ 2.42
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PtprkP35822 1457 aa30.17■■■□□ 2.42
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Crocc2F6XLV1 1638 aa30.06■■■□□ 2.4
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Myt1lP97500 1187 aa29.83■■■□□ 2.37
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa29.83■■■□□ 2.37
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Grin2aP35436 1464 aa29.53■■■□□ 2.32
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pla2r1Q62028 1487 aa29.49■■■□□ 2.31
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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Cnn3-201ENSMUST00000029773 Setd1bQ8CFT2 1985 aa29.4■■■□□ 2.3
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