RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.04■■□□□ 1.12
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ino80Q6ZPV2 1559 aa22.01■■□□□ 1.11
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nol12Q8BG17 217 aa21.99■■□□□ 1.11
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trim44Q9QXA7 346 aa21.99■■□□□ 1.11
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sv2bQ8BG39 683 aa21.98■■□□□ 1.11
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kif24Q6NWW5 1356 aa21.98■■□□□ 1.11
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa21.96■■□□□ 1.11
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem132eQ6IEE6 982 aa21.92■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hecw2Q6I6G8 1578 aa21.92■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cpa2Q504N0 417 aa21.92■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bag4Q8CI61 457 aa21.91■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bcl2l13P59017 434 aa21.91■■□□□ 1.1
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Ptpra-201ENSMUST00000028769 AglF8VPN4 1532 aa21.9■■□□□ 1.1
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q3UJC8 639 aa21.9■■□□□ 1.1
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