RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028248.10

Ttll11-201, Transcript of Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttll11, Length 3,176 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gadd45bP22339 160 aa17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Cpa2Q504N0 417 aa17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Ush1cQ9ES64 910 aa17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Clcn1Q64347 994 aa17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Tmx3Q8BXZ1 456 aa17.9■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 TimelessQ9R1X4 1197 aa17.89■□□□□ 0.46
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa17.89■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Tpm2P58774 284 aa17.89■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gzf1Q4VBD9 706 aa17.89■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Serpina10Q8R121 448 aa17.89■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gdpd2Q9ESM6 539 aa17.88■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Fam135bQ9DAI6 1403 aa17.88■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Triml2E9PW10 424 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Fam13bQ8K2H3 851 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Nphp4P59240 1425 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 CastP51125 788 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Mknk2Q8CDB0 459 aa17.87■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Kif13aQ9EQW7 1749 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gm9992B2RWK3 458 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Vgll3P85442 326 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Unc93aQ710D3 458 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 RictorQ6QI06 1708 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 PtprmP28828 1452 aa17.86■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gm10093D3YYI8 482 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Tnnt2P50752 301 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Cers3Q1A3B0 383 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Znf316Q6PGE4 1016 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 KdrP35918 1367 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Birc3O08863 600 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Becn1O88597 448 aa17.85■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Wdr63B2RY71 923 aa17.84■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Pcmtd1P59913 357 aa17.84■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Rsph4aQ8BYM7 716 aa17.84■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 DnmbpQ6TXD4 1580 aa17.83■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Q3UPC7 1272 aa17.83■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa17.83■□□□□ 0.45
Ttll11-201ENSMUST00000028248 IqubQ8CDK3 788 aa17.83■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Babam1Q3UI43 333 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Lrrc7Q80TE7 1490 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Phactr2B1AVP0 632 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Irx6Q9ER75 438 aa17.82■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Bach1P97302 739 aa17.81■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa17.81■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Klhdc4Q921I2 584 aa17.81■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa17.81■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 FanclQ9CR14 375 aa17.81■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Mcm10Q0VBD2 885 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Q9D2X8 372 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Shq1Q7TMX5 569 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Slc52a2Q9D8F3 450 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 PalldQ9ET54 1408 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Naip7Q9JIB3 1402 aa17.79■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa17.78■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Zhx1P70121 873 aa17.78■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Rcan3Q9JKK0 239 aa17.78■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Naa30Q8CES0 364 aa17.77■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Chd1lQ9CXF7 900 aa17.77■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gse1Q3U3C9 1213 aa17.77■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa17.77■□□□□ 0.44
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Zscan25B2RX31 543 aa17.76■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Tshz3Q8CGV9 1081 aa17.76■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Ift172Q6VH22 1749 aa17.76■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Olfml1Q8BSH2 233 aa17.75■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 PalmQ9Z0P4 383 aa17.75■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 MpndQ3TV65 487 aa17.75■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa17.74■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Q9D9H8 365 aa17.74■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Usp16Q99LG0 825 aa17.74■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 MsnP26041 577 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Aifm3Q3TY86 605 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Pnma3Q8JZW8 466 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Fez1Q8K0X8 392 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Slc12a5Q91V14 1138 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 CenpjQ569L8 1344 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Ric3Q8BPM6 367 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Gripap1Q8VD04 806 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Arhgef28P97433 1693 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Trim27Q62158 513 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Cavin4A2AMM0 362 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ttll11-201ENSMUST00000028248 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.3 ms