RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 IlkapQ8R0F6 392 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NamptQ99KQ4 491 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 IgtpQ9DCE9 423 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Col18a1P39061 1774 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MipepA6H611 711 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mkrn2osD3Z393 217 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 P01740 135 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Htr5bP31387 370 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adra1dP97714 562 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kcnc2Q14B80 642 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gstt1Q64471 240 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PimregQ8BFY7 231 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vps26bQ8C0E2 336 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sgpl1Q8R0X7 568 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Akr1c13Q8VC28 323 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rsl24d1Q99L28 163 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 XpotQ9CRT8 963 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 FocadA2AKG8 1798 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ThbdP15306 577 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Clec4b1Q7TS58 209 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kansl2Q8BQR4 486 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 SowahcQ8C0J6 512 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 BsndQ8VIM4 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TmlheQ91ZE0 421 aa13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lzts3A2AHG0 700 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1123A2AT85 323 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm3259D3YUK0 475 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pacs2Q3V3Q7 862 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Impg1Q8R1W8 798 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc13a3Q91Y63 600 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nck1Q99M51 377 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cpxm2Q9D2L5 764 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slamf8Q9D3G2 278 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Clcn5Q9WVD4 746 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa13.58□□□□□ -0.23
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 LynP25911 512 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ErfP70459 551 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Q3U4G0 281 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Serpina3gQ5I2A0 440 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Myo1dQ5SYD0 1006 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem270Q6UJB9 264 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TpbglQ8C013 384 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lrrc40Q9CRC8 602 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zcchc12Q9CZA5 402 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 CtsmQ9JL96 333 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 EXOC1LB9EK06 172 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm5152L7N200 190 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Clec2lP0C7M9 211 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Agtr2P35374 363 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Usp46P62069 366 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ezh1P70351 747 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PamP97467 979 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Serac1Q3U213 654 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RhocQ62159 193 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sfr1Q8BP27 319 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dennd1cQ8CFK6 786 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PolbQ8K409 335 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tcaf2Q921K8 919 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tas1r3Q925D8 858 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dpy30Q99LT0 99 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ly6iQ9WU67 134 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Spag17Q5S003 2320 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn2r14E9Q759 848 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cntn3Q07409 1028 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Col28a1Q2UY11 1141 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mef2dQ63943 514 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdc14bQ6PFY9 485 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atp2c1Q80XR2 918 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Snx17Q8BVL3 470 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mark1Q8VHJ5 795 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MmadhcQ99LS1 296 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccdc86Q9JJ89 426 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ApipQ9WVQ5 241 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa13.58□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pkd2l1A2A259 760 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gbp4A4UUI3 631 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm10720D3Z1I5 223 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp946F6VWU8 523 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Azin1O35484 448 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Orm2P07361 207 aa13.57□□□□□ -0.24
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rab26Q504M8 260 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms