Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F6

Ilkap, Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkapQ8R0F6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
IlkapQ8R0F6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IlkapQ8R0F6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IlkapQ8R0F6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IlkapQ8R0F6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
IlkapQ8R0F6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IlkapQ8R0F6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IlkapQ8R0F6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IlkapQ8R0F6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IlkapQ8R0F6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IlkapQ8R0F6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IlkapQ8R0F6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IlkapQ8R0F6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IlkapQ8R0F6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IlkapQ8R0F6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IlkapQ8R0F6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IlkapQ8R0F6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IlkapQ8R0F6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IlkapQ8R0F6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IlkapQ8R0F6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IlkapQ8R0F6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IlkapQ8R0F6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IlkapQ8R0F6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IlkapQ8R0F6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IlkapQ8R0F6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IlkapQ8R0F6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IlkapQ8R0F6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IlkapQ8R0F6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IlkapQ8R0F6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IlkapQ8R0F6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IlkapQ8R0F6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IlkapQ8R0F6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IlkapQ8R0F6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IlkapQ8R0F6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IlkapQ8R0F6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IlkapQ8R0F6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IlkapQ8R0F6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IlkapQ8R0F6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IlkapQ8R0F6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IlkapQ8R0F6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IlkapQ8R0F6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IlkapQ8R0F6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IlkapQ8R0F6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IlkapQ8R0F6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IlkapQ8R0F6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IlkapQ8R0F6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IlkapQ8R0F6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IlkapQ8R0F6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IlkapQ8R0F6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IlkapQ8R0F6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IlkapQ8R0F6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IlkapQ8R0F6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IlkapQ8R0F6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IlkapQ8R0F6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IlkapQ8R0F6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IlkapQ8R0F6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IlkapQ8R0F6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IlkapQ8R0F6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IlkapQ8R0F6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IlkapQ8R0F6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IlkapQ8R0F6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IlkapQ8R0F6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IlkapQ8R0F6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IlkapQ8R0F6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IlkapQ8R0F6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IlkapQ8R0F6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IlkapQ8R0F6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IlkapQ8R0F6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IlkapQ8R0F6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IlkapQ8R0F6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IlkapQ8R0F6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IlkapQ8R0F6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IlkapQ8R0F6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IlkapQ8R0F6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IlkapQ8R0F6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IlkapQ8R0F6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IlkapQ8R0F6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IlkapQ8R0F6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IlkapQ8R0F6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IlkapQ8R0F6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IlkapQ8R0F6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IlkapQ8R0F6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IlkapQ8R0F6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IlkapQ8R0F6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IlkapQ8R0F6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IlkapQ8R0F6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IlkapQ8R0F6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IlkapQ8R0F6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IlkapQ8R0F6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IlkapQ8R0F6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IlkapQ8R0F6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IlkapQ8R0F6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IlkapQ8R0F6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IlkapQ8R0F6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IlkapQ8R0F6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 525.2 ms