Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,6■■■■□ 3,93
Ctxn3Q8BXZ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Ctxn3Q8BXZ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Ctxn3Q8BXZ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Ctxn3Q8BXZ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ctxn3Q8BXZ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Ctxn3Q8BXZ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
Ctxn3Q8BXZ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ctxn3Q8BXZ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Ctxn3Q8BXZ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Ctxn3Q8BXZ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Ctxn3Q8BXZ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ctxn3Q8BXZ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,63■■■□□ 2,81
Ctxn3Q8BXZ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Ctxn3Q8BXZ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Ctxn3Q8BXZ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Ctxn3Q8BXZ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ctxn3Q8BXZ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Ctxn3Q8BXZ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Ctxn3Q8BXZ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Ctxn3Q8BXZ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Ctxn3Q8BXZ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
Ctxn3Q8BXZ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Ctxn3Q8BXZ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Ctxn3Q8BXZ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Ctxn3Q8BXZ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Ctxn3Q8BXZ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Ctxn3Q8BXZ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Ctxn3Q8BXZ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Ctxn3Q8BXZ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ctxn3Q8BXZ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ctxn3Q8BXZ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ctxn3Q8BXZ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ctxn3Q8BXZ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Ctxn3Q8BXZ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ctxn3Q8BXZ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ctxn3Q8BXZ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ctxn3Q8BXZ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ctxn3Q8BXZ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Ctxn3Q8BXZ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ctxn3Q8BXZ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Ctxn3Q8BXZ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ctxn3Q8BXZ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ctxn3Q8BXZ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ctxn3Q8BXZ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ctxn3Q8BXZ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ctxn3Q8BXZ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ctxn3Q8BXZ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ctxn3Q8BXZ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ctxn3Q8BXZ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Ctxn3Q8BXZ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ctxn3Q8BXZ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ctxn3Q8BXZ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ctxn3Q8BXZ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Ctxn3Q8BXZ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ctxn3Q8BXZ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Ctxn3Q8BXZ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ctxn3Q8BXZ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ctxn3Q8BXZ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Ctxn3Q8BXZ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ctxn3Q8BXZ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ctxn3Q8BXZ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Ctxn3Q8BXZ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ctxn3Q8BXZ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ctxn3Q8BXZ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ctxn3Q8BXZ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ctxn3Q8BXZ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ctxn3Q8BXZ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ctxn3Q8BXZ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ctxn3Q8BXZ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ctxn3Q8BXZ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Ctxn3Q8BXZ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ctxn3Q8BXZ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ctxn3Q8BXZ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ctxn3Q8BXZ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ctxn3Q8BXZ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ctxn3Q8BXZ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ctxn3Q8BXZ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms