Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ErfP70459 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ErfP70459 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ErfP70459 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ErfP70459 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ErfP70459 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ErfP70459 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ErfP70459 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ErfP70459 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ErfP70459 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ErfP70459 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ErfP70459 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ErfP70459 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ErfP70459 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ErfP70459 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ErfP70459 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ErfP70459 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ErfP70459 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ErfP70459 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ErfP70459 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ErfP70459 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ErfP70459 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ErfP70459 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ErfP70459 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ErfP70459 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ErfP70459 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ErfP70459 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ErfP70459 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ErfP70459 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ErfP70459 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ErfP70459 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ErfP70459 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ErfP70459 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ErfP70459 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ErfP70459 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ErfP70459 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ErfP70459 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ErfP70459 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ErfP70459 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ErfP70459 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ErfP70459 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ErfP70459 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ErfP70459 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ErfP70459 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ErfP70459 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ErfP70459 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ErfP70459 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ErfP70459 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ErfP70459 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ErfP70459 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ErfP70459 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ErfP70459 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ErfP70459 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ErfP70459 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ErfP70459 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ErfP70459 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ErfP70459 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ErfP70459 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ErfP70459 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ErfP70459 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ErfP70459 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ErfP70459 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ErfP70459 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ErfP70459 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ErfP70459 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ErfP70459 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ErfP70459 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ErfP70459 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ErfP70459 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ErfP70459 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ErfP70459 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ErfP70459 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ErfP70459 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ErfP70459 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ErfP70459 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ErfP70459 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErfP70459 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ErfP70459 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ErfP70459 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErfP70459 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErfP70459 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErfP70459 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ErfP70459 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ErfP70459 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ErfP70459 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErfP70459 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ErfP70459 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ErfP70459 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErfP70459 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ErfP70459 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErfP70459 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ErfP70459 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ErfP70459 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErfP70459 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErfP70459 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ErfP70459 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ErfP70459 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ErfP70459 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ErfP70459 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ErfP70459 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.2 ms