Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Myo1dQ5SYD0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo1dQ5SYD0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo1dQ5SYD0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo1dQ5SYD0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo1dQ5SYD0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Myo1dQ5SYD0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Myo1dQ5SYD0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Myo1dQ5SYD0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo1dQ5SYD0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Myo1dQ5SYD0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo1dQ5SYD0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Myo1dQ5SYD0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Myo1dQ5SYD0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Myo1dQ5SYD0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Myo1dQ5SYD0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Myo1dQ5SYD0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Myo1dQ5SYD0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Myo1dQ5SYD0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myo1dQ5SYD0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Myo1dQ5SYD0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myo1dQ5SYD0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo1dQ5SYD0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo1dQ5SYD0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo1dQ5SYD0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo1dQ5SYD0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo1dQ5SYD0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo1dQ5SYD0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo1dQ5SYD0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo1dQ5SYD0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo1dQ5SYD0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo1dQ5SYD0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myo1dQ5SYD0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo1dQ5SYD0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Myo1dQ5SYD0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myo1dQ5SYD0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo1dQ5SYD0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo1dQ5SYD0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Myo1dQ5SYD0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myo1dQ5SYD0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo1dQ5SYD0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1dQ5SYD0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1dQ5SYD0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1dQ5SYD0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo1dQ5SYD0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo1dQ5SYD0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo1dQ5SYD0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo1dQ5SYD0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1dQ5SYD0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1dQ5SYD0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo1dQ5SYD0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo1dQ5SYD0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo1dQ5SYD0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo1dQ5SYD0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo1dQ5SYD0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo1dQ5SYD0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myo1dQ5SYD0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Myo1dQ5SYD0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo1dQ5SYD0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo1dQ5SYD0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo1dQ5SYD0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo1dQ5SYD0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo1dQ5SYD0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Myo1dQ5SYD0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo1dQ5SYD0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo1dQ5SYD0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo1dQ5SYD0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1dQ5SYD0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo1dQ5SYD0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo1dQ5SYD0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo1dQ5SYD0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1dQ5SYD0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1dQ5SYD0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1dQ5SYD0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1dQ5SYD0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myo1dQ5SYD0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myo1dQ5SYD0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myo1dQ5SYD0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myo1dQ5SYD0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1dQ5SYD0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1dQ5SYD0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myo1dQ5SYD0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myo1dQ5SYD0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myo1dQ5SYD0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo1dQ5SYD0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myo1dQ5SYD0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myo1dQ5SYD0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myo1dQ5SYD0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1dQ5SYD0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myo1dQ5SYD0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myo1dQ5SYD0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myo1dQ5SYD0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myo1dQ5SYD0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myo1dQ5SYD0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms