Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Top3bQ9Z321 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Top3bQ9Z321 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top3bQ9Z321 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Top3bQ9Z321 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Top3bQ9Z321 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top3bQ9Z321 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top3bQ9Z321 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top3bQ9Z321 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top3bQ9Z321 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top3bQ9Z321 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Top3bQ9Z321 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Top3bQ9Z321 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Top3bQ9Z321 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top3bQ9Z321 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top3bQ9Z321 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top3bQ9Z321 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top3bQ9Z321 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top3bQ9Z321 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top3bQ9Z321 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top3bQ9Z321 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top3bQ9Z321 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Top3bQ9Z321 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top3bQ9Z321 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Top3bQ9Z321 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top3bQ9Z321 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top3bQ9Z321 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Top3bQ9Z321 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top3bQ9Z321 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top3bQ9Z321 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top3bQ9Z321 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top3bQ9Z321 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top3bQ9Z321 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Top3bQ9Z321 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top3bQ9Z321 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top3bQ9Z321 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top3bQ9Z321 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top3bQ9Z321 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top3bQ9Z321 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top3bQ9Z321 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Top3bQ9Z321 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top3bQ9Z321 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top3bQ9Z321 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Top3bQ9Z321 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top3bQ9Z321 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Top3bQ9Z321 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Top3bQ9Z321 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Top3bQ9Z321 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Top3bQ9Z321 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top3bQ9Z321 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top3bQ9Z321 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top3bQ9Z321 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Top3bQ9Z321 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top3bQ9Z321 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top3bQ9Z321 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top3bQ9Z321 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top3bQ9Z321 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top3bQ9Z321 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top3bQ9Z321 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top3bQ9Z321 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Top3bQ9Z321 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top3bQ9Z321 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Top3bQ9Z321 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top3bQ9Z321 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top3bQ9Z321 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top3bQ9Z321 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top3bQ9Z321 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top3bQ9Z321 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top3bQ9Z321 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top3bQ9Z321 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Top3bQ9Z321 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top3bQ9Z321 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top3bQ9Z321 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top3bQ9Z321 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top3bQ9Z321 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top3bQ9Z321 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Top3bQ9Z321 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top3bQ9Z321 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top3bQ9Z321 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top3bQ9Z321 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top3bQ9Z321 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top3bQ9Z321 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Top3bQ9Z321 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top3bQ9Z321 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top3bQ9Z321 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top3bQ9Z321 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top3bQ9Z321 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top3bQ9Z321 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top3bQ9Z321 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Top3bQ9Z321 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms