Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,83■■■■□ 3,97
Cntn3Q07409 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cntn3Q07409 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Cntn3Q07409 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Cntn3Q07409 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cntn3Q07409 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Cntn3Q07409 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Cntn3Q07409 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Cntn3Q07409 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Cntn3Q07409 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cntn3Q07409 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cntn3Q07409 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cntn3Q07409 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Cntn3Q07409 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cntn3Q07409 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cntn3Q07409 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cntn3Q07409 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,45■■■□□ 2,78
Cntn3Q07409 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cntn3Q07409 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Cntn3Q07409 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Cntn3Q07409 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Cntn3Q07409 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cntn3Q07409 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
Cntn3Q07409 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cntn3Q07409 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Cntn3Q07409 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Cntn3Q07409 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Cntn3Q07409 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Cntn3Q07409 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Cntn3Q07409 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,76■■■□□ 2,68
Cntn3Q07409 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cntn3Q07409 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Cntn3Q07409 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Cntn3Q07409 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Cntn3Q07409 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Cntn3Q07409 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Cntn3Q07409 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Cntn3Q07409 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Cntn3Q07409 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cntn3Q07409 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cntn3Q07409 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cntn3Q07409 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cntn3Q07409 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cntn3Q07409 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cntn3Q07409 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Cntn3Q07409 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cntn3Q07409 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Cntn3Q07409 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cntn3Q07409 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cntn3Q07409 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Cntn3Q07409 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cntn3Q07409 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cntn3Q07409 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Cntn3Q07409 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cntn3Q07409 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cntn3Q07409 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntn3Q07409 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntn3Q07409 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntn3Q07409 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Cntn3Q07409 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Cntn3Q07409 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Cntn3Q07409 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cntn3Q07409 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cntn3Q07409 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Cntn3Q07409 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cntn3Q07409 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Cntn3Q07409 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Cntn3Q07409 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cntn3Q07409 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cntn3Q07409 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cntn3Q07409 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cntn3Q07409 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cntn3Q07409 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cntn3Q07409 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cntn3Q07409 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Cntn3Q07409 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Cntn3Q07409 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Cntn3Q07409 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Cntn3Q07409 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cntn3Q07409 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cntn3Q07409 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cntn3Q07409 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cntn3Q07409 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cntn3Q07409 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cntn3Q07409 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cntn3Q07409 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Cntn3Q07409 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cntn3Q07409 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cntn3Q07409 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Cntn3Q07409 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Cntn3Q07409 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Cntn3Q07409 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cntn3Q07409 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cntn3Q07409 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cntn3Q07409 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cntn3Q07409 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cntn3Q07409 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cntn3Q07409 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cntn3Q07409 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cntn3Q07409 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,9 ms