Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Cntnap5aQ0V8T9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cntnap5aQ0V8T9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cntnap5aQ0V8T9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Cntnap5aQ0V8T9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Cntnap5aQ0V8T9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cntnap5aQ0V8T9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cntnap5aQ0V8T9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cntnap5aQ0V8T9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cntnap5aQ0V8T9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cntnap5aQ0V8T9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cntnap5aQ0V8T9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Cntnap5aQ0V8T9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cntnap5aQ0V8T9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cntnap5aQ0V8T9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cntnap5aQ0V8T9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cntnap5aQ0V8T9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cntnap5aQ0V8T9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cntnap5aQ0V8T9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cntnap5aQ0V8T9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cntnap5aQ0V8T9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cntnap5aQ0V8T9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cntnap5aQ0V8T9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cntnap5aQ0V8T9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cntnap5aQ0V8T9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cntnap5aQ0V8T9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cntnap5aQ0V8T9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cntnap5aQ0V8T9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cntnap5aQ0V8T9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cntnap5aQ0V8T9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cntnap5aQ0V8T9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cntnap5aQ0V8T9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cntnap5aQ0V8T9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cntnap5aQ0V8T9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cntnap5aQ0V8T9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cntnap5aQ0V8T9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cntnap5aQ0V8T9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cntnap5aQ0V8T9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cntnap5aQ0V8T9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cntnap5aQ0V8T9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cntnap5aQ0V8T9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cntnap5aQ0V8T9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cntnap5aQ0V8T9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cntnap5aQ0V8T9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Cntnap5aQ0V8T9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cntnap5aQ0V8T9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cntnap5aQ0V8T9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Cntnap5aQ0V8T9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cntnap5aQ0V8T9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cntnap5aQ0V8T9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cntnap5aQ0V8T9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cntnap5aQ0V8T9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cntnap5aQ0V8T9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cntnap5aQ0V8T9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Cntnap5aQ0V8T9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cntnap5aQ0V8T9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cntnap5aQ0V8T9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cntnap5aQ0V8T9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cntnap5aQ0V8T9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Cntnap5aQ0V8T9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cntnap5aQ0V8T9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cntnap5aQ0V8T9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cntnap5aQ0V8T9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cntnap5aQ0V8T9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Cntnap5aQ0V8T9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cntnap5aQ0V8T9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cntnap5aQ0V8T9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cntnap5aQ0V8T9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms