RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578861.5

SNX11-205, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

TSL 4

Gene SNX11, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-205ENST00000578861 MT-CO1P00395 513 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 AKT2P31751 481 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PPP1R2P41236 205 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ADKP55263 362 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TAS2R38P59533 333 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CDC20Q12834 499 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 C1orf61Q13536 156 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ESPL1Q14674 2120 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 EFHC1Q5JVL4 640 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PHF19Q5T6S3 580 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CCDC13Q8IYE1 715 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 WDTC1Q8N5D0 677 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ATP11CQ8NB49 1132 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ALG14Q96F25 216 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TIGD1Q96MW7 591 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SLC2A13Q96QE2 648 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CPXM1Q96SM3 734 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SIRPGQ9P1W8 387 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SNX10Q9Y5X0 201 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 HS3ST4Q9Y661 456 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 MED13LQ71F56 2210 aa9□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 BECN2A8MW95 431 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 M0QYT0 321 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ALOX15BO15296 676 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SNAP91O60641 907 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 HSF2BPO75031 334 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PAGE1O75459 146 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CLDN11O75508 207 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ENDOD1O94919 500 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PCDH8O95206 1070 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 GNA14O95837 355 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ERBB2P04626 1255 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CTSLP07711 333 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ANXA6P08133 673 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RHOCP08134 193 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SRCP12931 536 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 DRD2P14416 443 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 JUNDP17535 347 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SLC9A1P19634 815 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RRM1P23921 792 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CCKBRP32239 447 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CHRNA3P32297 505 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 MEA1Q16626 185 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ZNF284Q2VY69 593 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 LINGO4Q6UY18 593 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CHST14Q8NCH0 376 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 IFT43Q96FT9 208 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SYNCQ9H7C4 482 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 DYRK4Q9NR20 520 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RRN3Q9NYV6 651 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RNF103O00237 685 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ADCY5O95622 1261 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CSF2P04141 144 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 GLI1P08151 1106 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 CCL4P13236 92 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 UGT1A3P35503 534 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 KRT83P78385 493 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PAK1Q13153 545 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 FZD2Q14332 565 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ALFQ53S48 1182 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 ARSIQ5FYB1 569 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.98□□□□□ -0.97
SNX11-205ENST00000578861 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms