RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Phka1P18826 1241 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Epb42P49222 691 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ZyxQ62523 564 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trpm4Q7TN37 1213 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 BsndQ8VIM4 307 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Efhc1Q9D9T8 648 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arih1Q9Z1K5 555 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf608Q56A10 1511 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r2A2AMT6 306 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp712E9PXJ4 705 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ebf3O08791 596 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fndc11Q80WB0 326 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnm1lQ8K1M6 742 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem246Q91YV9 403 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Syvn1Q9DBY1 612 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 EefsecQ9JHW4 583 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rgs1Q9JL25 209 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kdelc2G5E897 503 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 H2-Eb1P04230 264 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MipP51180 263 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TgfbiP82198 683 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ZbbxQ0P5X5 716 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hhla1Q3TYV2 514 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Serpina3gQ5I2A0 440 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Calm5Q6W3E0 140 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc39a14Q75N73 489 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Snrnp48Q9D361 337 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rcan1Q9JHG6 198 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Erich3F6QRE9 1637 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr564E9PWA8 316 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr743L7N1Y2 311 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 RxrgP28705 463 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Htr4P97288 388 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ChpfQ6IQX7 774 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdh24Q6PFX6 781 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AbraQ8BUZ1 375 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acsm2Q8K0L3 575 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acad10Q8K370 1069 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1352Q8VGX5 309 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Snx4Q91YJ2 450 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klrc2Q9WTJ9 238 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MthfrQ9WU20 654 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hpcal1P62748 193 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HmgcrQ01237 887 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trim40Q3UWA4 246 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyth4Q80YW0 393 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sh3rf3Q8C120 878 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr784Q8VFZ9 319 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pskh1Q91YA2 424 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm17333C6EQI3 125 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm5849J3QPE5 117 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TpmtO55060 240 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AlbP07724 608 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TubP50586 505 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nup62Q63850 526 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 N4bp1Q6A037 893 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MaelQ8BVN9 434 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mab21L3Q8CI17 429 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Scamp1Q8K021 338 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trappc12Q8K2L8 797 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndufs2Q91WD5 463 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stard13Q923Q2 1113 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 IqchQ9D2K4 1071 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr706Q9EPF8 316 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc13a2Q9ES88 586 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Usp21Q9QZL6 566 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ces1bD3Z5G7 567 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnt2D3Z649 1135 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Apold1E9Q0X2 246 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GzmgP13366 248 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp2d11P24457 504 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ptpn11P35235 597 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nudt2P56380 147 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ncf4P97369 339 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CtscP97821 462 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Coq10bQ3THF9 240 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 OgtQ8CGY8 1046 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr808Q8VGI8 312 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcdha3Q91Y16 942 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rgs18Q99PG4 235 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dlgap1Q9D415 992 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rin2Q9D684 903 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfyve9A2A8R0 1397 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm4131A0A140LJ24 318 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndufaf6A2AIL4 333 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttll3A4Q9E5 927 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc23lA6H6E9 458 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm6351K9J7D1 481 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Clk1P22518 483 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms