Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0L3

Acsm2, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm2Q8K0L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Acsm2Q8K0L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Acsm2Q8K0L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Acsm2Q8K0L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Acsm2Q8K0L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Acsm2Q8K0L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Acsm2Q8K0L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Acsm2Q8K0L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Acsm2Q8K0L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Acsm2Q8K0L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Acsm2Q8K0L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Acsm2Q8K0L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Acsm2Q8K0L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Acsm2Q8K0L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Acsm2Q8K0L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Acsm2Q8K0L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Acsm2Q8K0L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Acsm2Q8K0L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Acsm2Q8K0L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Acsm2Q8K0L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Acsm2Q8K0L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Acsm2Q8K0L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Acsm2Q8K0L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Acsm2Q8K0L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Acsm2Q8K0L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Acsm2Q8K0L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Acsm2Q8K0L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Acsm2Q8K0L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Acsm2Q8K0L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Acsm2Q8K0L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Acsm2Q8K0L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Acsm2Q8K0L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Acsm2Q8K0L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Acsm2Q8K0L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Acsm2Q8K0L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Acsm2Q8K0L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Acsm2Q8K0L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Acsm2Q8K0L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Acsm2Q8K0L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Acsm2Q8K0L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Acsm2Q8K0L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Acsm2Q8K0L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Acsm2Q8K0L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acsm2Q8K0L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Acsm2Q8K0L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Acsm2Q8K0L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Acsm2Q8K0L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Acsm2Q8K0L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Acsm2Q8K0L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Acsm2Q8K0L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Acsm2Q8K0L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Acsm2Q8K0L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Acsm2Q8K0L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Acsm2Q8K0L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Acsm2Q8K0L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Acsm2Q8K0L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Acsm2Q8K0L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Acsm2Q8K0L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Acsm2Q8K0L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Acsm2Q8K0L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Acsm2Q8K0L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Acsm2Q8K0L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Acsm2Q8K0L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Acsm2Q8K0L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acsm2Q8K0L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Acsm2Q8K0L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Acsm2Q8K0L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Acsm2Q8K0L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Acsm2Q8K0L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acsm2Q8K0L3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Acsm2Q8K0L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Acsm2Q8K0L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Acsm2Q8K0L3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Acsm2Q8K0L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Acsm2Q8K0L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Acsm2Q8K0L3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Acsm2Q8K0L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Acsm2Q8K0L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Acsm2Q8K0L3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Acsm2Q8K0L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Acsm2Q8K0L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Acsm2Q8K0L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Acsm2Q8K0L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Acsm2Q8K0L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Acsm2Q8K0L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Acsm2Q8K0L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Acsm2Q8K0L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Acsm2Q8K0L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Acsm2Q8K0L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsm2Q8K0L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsm2Q8K0L3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Acsm2Q8K0L3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsm2Q8K0L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsm2Q8K0L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsm2Q8K0L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acsm2Q8K0L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acsm2Q8K0L3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acsm2Q8K0L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acsm2Q8K0L3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Acsm2Q8K0L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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