Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Vmn1r2A2AMT6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Vmn1r2A2AMT6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Vmn1r2A2AMT6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Vmn1r2A2AMT6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Vmn1r2A2AMT6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Vmn1r2A2AMT6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Vmn1r2A2AMT6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vmn1r2A2AMT6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Vmn1r2A2AMT6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vmn1r2A2AMT6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Vmn1r2A2AMT6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vmn1r2A2AMT6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vmn1r2A2AMT6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vmn1r2A2AMT6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Vmn1r2A2AMT6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vmn1r2A2AMT6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vmn1r2A2AMT6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Vmn1r2A2AMT6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vmn1r2A2AMT6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vmn1r2A2AMT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vmn1r2A2AMT6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Vmn1r2A2AMT6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vmn1r2A2AMT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vmn1r2A2AMT6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn1r2A2AMT6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Vmn1r2A2AMT6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vmn1r2A2AMT6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Vmn1r2A2AMT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn1r2A2AMT6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Vmn1r2A2AMT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vmn1r2A2AMT6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vmn1r2A2AMT6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vmn1r2A2AMT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vmn1r2A2AMT6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vmn1r2A2AMT6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r2A2AMT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vmn1r2A2AMT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vmn1r2A2AMT6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vmn1r2A2AMT6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Vmn1r2A2AMT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vmn1r2A2AMT6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vmn1r2A2AMT6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vmn1r2A2AMT6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vmn1r2A2AMT6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn1r2A2AMT6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn1r2A2AMT6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn1r2A2AMT6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn1r2A2AMT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r2A2AMT6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r2A2AMT6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r2A2AMT6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r2A2AMT6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vmn1r2A2AMT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r2A2AMT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Vmn1r2A2AMT6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vmn1r2A2AMT6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r2A2AMT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vmn1r2A2AMT6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn1r2A2AMT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r2A2AMT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vmn1r2A2AMT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vmn1r2A2AMT6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r2A2AMT6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn1r2A2AMT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn1r2A2AMT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn1r2A2AMT6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r2A2AMT6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r2A2AMT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r2A2AMT6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn1r2A2AMT6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r2A2AMT6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r2A2AMT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn1r2A2AMT6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r2A2AMT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r2A2AMT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r2A2AMT6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r2A2AMT6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r2A2AMT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r2A2AMT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r2A2AMT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r2A2AMT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vmn1r2A2AMT6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r2A2AMT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vmn1r2A2AMT6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r2A2AMT6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vmn1r2A2AMT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r2A2AMT6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r2A2AMT6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r2A2AMT6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r2A2AMT6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn1r2A2AMT6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms