Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,81■■■■■ 4,44
Rcan1Q9JHG6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Rcan1Q9JHG6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Rcan1Q9JHG6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Rcan1Q9JHG6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Rcan1Q9JHG6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
Rcan1Q9JHG6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,03■■■■□ 3,68
Rcan1Q9JHG6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,33■■■■□ 3,57
Rcan1Q9JHG6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Rcan1Q9JHG6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,96■■■■□ 3,51
Rcan1Q9JHG6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,86■■■■□ 3,49
Rcan1Q9JHG6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Rcan1Q9JHG6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Rcan1Q9JHG6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Rcan1Q9JHG6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Rcan1Q9JHG6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Rcan1Q9JHG6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Rcan1Q9JHG6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Rcan1Q9JHG6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Rcan1Q9JHG6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Rcan1Q9JHG6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Rcan1Q9JHG6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Rcan1Q9JHG6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Rcan1Q9JHG6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Rcan1Q9JHG6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Rcan1Q9JHG6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Rcan1Q9JHG6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Rcan1Q9JHG6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Rcan1Q9JHG6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Rcan1Q9JHG6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Rcan1Q9JHG6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Rcan1Q9JHG6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Rcan1Q9JHG6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Rcan1Q9JHG6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Rcan1Q9JHG6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Rcan1Q9JHG6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Rcan1Q9JHG6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Rcan1Q9JHG6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Rcan1Q9JHG6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Rcan1Q9JHG6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Rcan1Q9JHG6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Rcan1Q9JHG6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Rcan1Q9JHG6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Rcan1Q9JHG6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Rcan1Q9JHG6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Rcan1Q9JHG6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Rcan1Q9JHG6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Rcan1Q9JHG6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Rcan1Q9JHG6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Rcan1Q9JHG6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Rcan1Q9JHG6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Rcan1Q9JHG6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Rcan1Q9JHG6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Rcan1Q9JHG6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Rcan1Q9JHG6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Rcan1Q9JHG6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Rcan1Q9JHG6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Rcan1Q9JHG6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,59■■■□□ 2,97
Rcan1Q9JHG6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Rcan1Q9JHG6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Rcan1Q9JHG6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Rcan1Q9JHG6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Rcan1Q9JHG6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rcan1Q9JHG6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rcan1Q9JHG6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Rcan1Q9JHG6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Rcan1Q9JHG6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Rcan1Q9JHG6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Rcan1Q9JHG6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Rcan1Q9JHG6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Rcan1Q9JHG6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Rcan1Q9JHG6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Rcan1Q9JHG6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Rcan1Q9JHG6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Rcan1Q9JHG6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Rcan1Q9JHG6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Rcan1Q9JHG6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Rcan1Q9JHG6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rcan1Q9JHG6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rcan1Q9JHG6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Rcan1Q9JHG6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Rcan1Q9JHG6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Rcan1Q9JHG6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Rcan1Q9JHG6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Rcan1Q9JHG6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Rcan1Q9JHG6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Rcan1Q9JHG6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Rcan1Q9JHG6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Rcan1Q9JHG6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Rcan1Q9JHG6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rcan1Q9JHG6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rcan1Q9JHG6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Rcan1Q9JHG6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Rcan1Q9JHG6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Rcan1Q9JHG6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Rcan1Q9JHG6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Rcan1Q9JHG6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rcan1Q9JHG6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rcan1Q9JHG6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Rcan1Q9JHG6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
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