Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RxrgP28705 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RxrgP28705 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RxrgP28705 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RxrgP28705 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RxrgP28705 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RxrgP28705 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RxrgP28705 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RxrgP28705 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RxrgP28705 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RxrgP28705 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RxrgP28705 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RxrgP28705 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RxrgP28705 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RxrgP28705 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RxrgP28705 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RxrgP28705 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RxrgP28705 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RxrgP28705 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RxrgP28705 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RxrgP28705 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RxrgP28705 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RxrgP28705 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RxrgP28705 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RxrgP28705 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RxrgP28705 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RxrgP28705 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RxrgP28705 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RxrgP28705 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RxrgP28705 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RxrgP28705 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RxrgP28705 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RxrgP28705 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RxrgP28705 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RxrgP28705 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RxrgP28705 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RxrgP28705 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RxrgP28705 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RxrgP28705 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RxrgP28705 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RxrgP28705 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RxrgP28705 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RxrgP28705 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RxrgP28705 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RxrgP28705 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RxrgP28705 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RxrgP28705 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RxrgP28705 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RxrgP28705 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RxrgP28705 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RxrgP28705 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RxrgP28705 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RxrgP28705 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RxrgP28705 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RxrgP28705 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RxrgP28705 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RxrgP28705 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RxrgP28705 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RxrgP28705 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RxrgP28705 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RxrgP28705 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RxrgP28705 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RxrgP28705 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RxrgP28705 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RxrgP28705 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RxrgP28705 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RxrgP28705 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RxrgP28705 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RxrgP28705 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RxrgP28705 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RxrgP28705 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RxrgP28705 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RxrgP28705 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RxrgP28705 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RxrgP28705 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RxrgP28705 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RxrgP28705 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RxrgP28705 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RxrgP28705 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RxrgP28705 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RxrgP28705 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RxrgP28705 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RxrgP28705 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RxrgP28705 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RxrgP28705 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RxrgP28705 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RxrgP28705 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RxrgP28705 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RxrgP28705 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RxrgP28705 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RxrgP28705 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RxrgP28705 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RxrgP28705 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RxrgP28705 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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