Protein–RNA interactions for Protein: O55060

Tpmt, Thiopurine S-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpmtO55060 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TpmtO55060 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TpmtO55060 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TpmtO55060 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TpmtO55060 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TpmtO55060 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TpmtO55060 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TpmtO55060 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TpmtO55060 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TpmtO55060 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TpmtO55060 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TpmtO55060 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TpmtO55060 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TpmtO55060 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TpmtO55060 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TpmtO55060 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TpmtO55060 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TpmtO55060 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TpmtO55060 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TpmtO55060 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TpmtO55060 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TpmtO55060 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TpmtO55060 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TpmtO55060 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TpmtO55060 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TpmtO55060 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TpmtO55060 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TpmtO55060 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TpmtO55060 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TpmtO55060 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TpmtO55060 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TpmtO55060 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TpmtO55060 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TpmtO55060 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TpmtO55060 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TpmtO55060 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TpmtO55060 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TpmtO55060 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TpmtO55060 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TpmtO55060 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TpmtO55060 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TpmtO55060 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TpmtO55060 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TpmtO55060 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TpmtO55060 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TpmtO55060 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TpmtO55060 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TpmtO55060 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TpmtO55060 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TpmtO55060 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TpmtO55060 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TpmtO55060 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TpmtO55060 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TpmtO55060 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TpmtO55060 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TpmtO55060 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TpmtO55060 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TpmtO55060 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TpmtO55060 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TpmtO55060 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TpmtO55060 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TpmtO55060 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TpmtO55060 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TpmtO55060 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TpmtO55060 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TpmtO55060 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TpmtO55060 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TpmtO55060 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TpmtO55060 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TpmtO55060 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TpmtO55060 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TpmtO55060 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TpmtO55060 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TpmtO55060 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TpmtO55060 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TpmtO55060 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TpmtO55060 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TpmtO55060 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TpmtO55060 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TpmtO55060 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TpmtO55060 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TpmtO55060 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TpmtO55060 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TpmtO55060 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TpmtO55060 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TpmtO55060 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TpmtO55060 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TpmtO55060 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TpmtO55060 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TpmtO55060 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TpmtO55060 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TpmtO55060 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TpmtO55060 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TpmtO55060 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms