Protein–RNA interactions for Protein: Q62523

Zyx, Zyxin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZyxQ62523 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,66■■■■■ 4,9
ZyxQ62523 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
ZyxQ62523 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
ZyxQ62523 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
ZyxQ62523 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,17■■■■■ 4,02
ZyxQ62523 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
ZyxQ62523 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,59■■■■□ 3,93
ZyxQ62523 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,53■■■■□ 3,92
ZyxQ62523 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,46■■■■□ 3,91
ZyxQ62523 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
ZyxQ62523 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
ZyxQ62523 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
ZyxQ62523 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,1■■■■□ 3,69
ZyxQ62523 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
ZyxQ62523 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,95■■■■□ 3,67
ZyxQ62523 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
ZyxQ62523 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
ZyxQ62523 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
ZyxQ62523 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
ZyxQ62523 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
ZyxQ62523 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
ZyxQ62523 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
ZyxQ62523 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
ZyxQ62523 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
ZyxQ62523 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
ZyxQ62523 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
ZyxQ62523 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
ZyxQ62523 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,01■■■■□ 3,51
ZyxQ62523 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
ZyxQ62523 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
ZyxQ62523 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
ZyxQ62523 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,52■■■■□ 3,44
ZyxQ62523 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,48■■■■□ 3,43
ZyxQ62523 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
ZyxQ62523 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
ZyxQ62523 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
ZyxQ62523 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
ZyxQ62523 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
ZyxQ62523 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36■■■■□ 3,35
ZyxQ62523 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
ZyxQ62523 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
ZyxQ62523 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
ZyxQ62523 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,78■■■■□ 3,32
ZyxQ62523 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
ZyxQ62523 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
ZyxQ62523 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
ZyxQ62523 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,28
ZyxQ62523 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
ZyxQ62523 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
ZyxQ62523 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
ZyxQ62523 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,26
ZyxQ62523 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
ZyxQ62523 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
ZyxQ62523 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
ZyxQ62523 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,25■■■■□ 3,23
ZyxQ62523 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,23■■■■□ 3,23
ZyxQ62523 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
ZyxQ62523 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
ZyxQ62523 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
ZyxQ62523 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
ZyxQ62523 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
ZyxQ62523 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
ZyxQ62523 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
ZyxQ62523 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
ZyxQ62523 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,87■■■■□ 3,17
ZyxQ62523 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
ZyxQ62523 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
ZyxQ62523 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
ZyxQ62523 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,73■■■■□ 3,15
ZyxQ62523 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
ZyxQ62523 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
ZyxQ62523 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,69■■■■□ 3,14
ZyxQ62523 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
ZyxQ62523 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
ZyxQ62523 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
ZyxQ62523 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,57■■■■□ 3,13
ZyxQ62523 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
ZyxQ62523 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
ZyxQ62523 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
ZyxQ62523 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
ZyxQ62523 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
ZyxQ62523 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
ZyxQ62523 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,24■■■■□ 3,07
ZyxQ62523 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
ZyxQ62523 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
ZyxQ62523 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
ZyxQ62523 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,18■■■■□ 3,06
ZyxQ62523 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
ZyxQ62523 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
ZyxQ62523 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,09■■■■□ 3,05
ZyxQ62523 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
ZyxQ62523 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
ZyxQ62523 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
ZyxQ62523 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
ZyxQ62523 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
ZyxQ62523 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
ZyxQ62523 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
ZyxQ62523 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
ZyxQ62523 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
ZyxQ62523 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms