Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TgfbiP82198 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TgfbiP82198 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TgfbiP82198 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TgfbiP82198 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TgfbiP82198 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TgfbiP82198 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TgfbiP82198 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TgfbiP82198 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TgfbiP82198 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TgfbiP82198 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TgfbiP82198 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TgfbiP82198 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TgfbiP82198 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TgfbiP82198 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TgfbiP82198 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TgfbiP82198 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TgfbiP82198 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TgfbiP82198 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TgfbiP82198 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TgfbiP82198 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TgfbiP82198 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TgfbiP82198 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TgfbiP82198 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TgfbiP82198 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TgfbiP82198 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TgfbiP82198 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TgfbiP82198 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TgfbiP82198 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TgfbiP82198 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TgfbiP82198 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TgfbiP82198 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TgfbiP82198 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TgfbiP82198 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TgfbiP82198 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TgfbiP82198 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TgfbiP82198 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TgfbiP82198 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TgfbiP82198 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TgfbiP82198 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TgfbiP82198 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TgfbiP82198 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TgfbiP82198 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TgfbiP82198 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TgfbiP82198 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TgfbiP82198 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TgfbiP82198 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TgfbiP82198 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TgfbiP82198 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TgfbiP82198 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TgfbiP82198 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TgfbiP82198 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TgfbiP82198 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TgfbiP82198 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TgfbiP82198 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TgfbiP82198 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TgfbiP82198 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TgfbiP82198 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TgfbiP82198 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TgfbiP82198 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TgfbiP82198 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TgfbiP82198 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TgfbiP82198 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TgfbiP82198 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TgfbiP82198 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TgfbiP82198 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TgfbiP82198 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TgfbiP82198 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TgfbiP82198 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TgfbiP82198 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TgfbiP82198 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TgfbiP82198 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TgfbiP82198 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TgfbiP82198 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TgfbiP82198 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TgfbiP82198 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TgfbiP82198 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TgfbiP82198 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TgfbiP82198 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TgfbiP82198 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TgfbiP82198 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TgfbiP82198 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TgfbiP82198 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TgfbiP82198 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TgfbiP82198 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TgfbiP82198 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TgfbiP82198 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TgfbiP82198 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TgfbiP82198 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TgfbiP82198 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TgfbiP82198 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TgfbiP82198 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TgfbiP82198 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TgfbiP82198 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TgfbiP82198 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TgfbiP82198 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TgfbiP82198 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TgfbiP82198 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TgfbiP82198 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TgfbiP82198 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms