Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Kdelc2G5E897 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdelc2G5E897 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdelc2G5E897 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdelc2G5E897 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdelc2G5E897 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdelc2G5E897 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdelc2G5E897 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdelc2G5E897 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdelc2G5E897 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdelc2G5E897 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdelc2G5E897 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdelc2G5E897 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdelc2G5E897 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdelc2G5E897 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdelc2G5E897 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdelc2G5E897 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdelc2G5E897 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdelc2G5E897 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdelc2G5E897 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdelc2G5E897 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdelc2G5E897 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdelc2G5E897 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdelc2G5E897 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdelc2G5E897 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdelc2G5E897 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdelc2G5E897 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdelc2G5E897 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdelc2G5E897 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Kdelc2G5E897 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdelc2G5E897 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdelc2G5E897 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdelc2G5E897 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Kdelc2G5E897 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdelc2G5E897 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdelc2G5E897 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdelc2G5E897 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdelc2G5E897 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdelc2G5E897 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdelc2G5E897 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdelc2G5E897 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdelc2G5E897 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdelc2G5E897 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdelc2G5E897 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdelc2G5E897 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdelc2G5E897 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdelc2G5E897 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdelc2G5E897 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdelc2G5E897 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Kdelc2G5E897 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Kdelc2G5E897 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Kdelc2G5E897 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Kdelc2G5E897 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Kdelc2G5E897 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Kdelc2G5E897 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Kdelc2G5E897 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdelc2G5E897 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdelc2G5E897 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdelc2G5E897 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kdelc2G5E897 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdelc2G5E897 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Kdelc2G5E897 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Kdelc2G5E897 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Kdelc2G5E897 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Kdelc2G5E897 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Kdelc2G5E897 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Kdelc2G5E897 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kdelc2G5E897 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kdelc2G5E897 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Kdelc2G5E897 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kdelc2G5E897 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Kdelc2G5E897 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Kdelc2G5E897 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdelc2G5E897 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdelc2G5E897 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdelc2G5E897 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdelc2G5E897 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdelc2G5E897 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdelc2G5E897 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdelc2G5E897 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kdelc2G5E897 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdelc2G5E897 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdelc2G5E897 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdelc2G5E897 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Kdelc2G5E897 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Kdelc2G5E897 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Kdelc2G5E897 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdelc2G5E897 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdelc2G5E897 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdelc2G5E897 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdelc2G5E897 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdelc2G5E897 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdelc2G5E897 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdelc2G5E897 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdelc2G5E897 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdelc2G5E897 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Kdelc2G5E897 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Kdelc2G5E897 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Kdelc2G5E897 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdelc2G5E897 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms