Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Snx4Q91YJ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Snx4Q91YJ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Snx4Q91YJ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Snx4Q91YJ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Snx4Q91YJ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Snx4Q91YJ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snx4Q91YJ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx4Q91YJ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snx4Q91YJ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Snx4Q91YJ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx4Q91YJ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx4Q91YJ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snx4Q91YJ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snx4Q91YJ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snx4Q91YJ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snx4Q91YJ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx4Q91YJ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx4Q91YJ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx4Q91YJ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx4Q91YJ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snx4Q91YJ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx4Q91YJ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx4Q91YJ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx4Q91YJ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx4Q91YJ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Snx4Q91YJ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snx4Q91YJ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx4Q91YJ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx4Q91YJ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx4Q91YJ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx4Q91YJ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx4Q91YJ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx4Q91YJ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx4Q91YJ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx4Q91YJ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx4Q91YJ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Snx4Q91YJ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx4Q91YJ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx4Q91YJ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx4Q91YJ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx4Q91YJ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx4Q91YJ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx4Q91YJ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx4Q91YJ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx4Q91YJ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx4Q91YJ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx4Q91YJ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx4Q91YJ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx4Q91YJ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx4Q91YJ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Snx4Q91YJ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx4Q91YJ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx4Q91YJ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx4Q91YJ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx4Q91YJ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx4Q91YJ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx4Q91YJ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx4Q91YJ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx4Q91YJ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx4Q91YJ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx4Q91YJ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx4Q91YJ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx4Q91YJ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx4Q91YJ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx4Q91YJ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx4Q91YJ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx4Q91YJ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx4Q91YJ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx4Q91YJ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx4Q91YJ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx4Q91YJ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx4Q91YJ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx4Q91YJ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx4Q91YJ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx4Q91YJ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx4Q91YJ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx4Q91YJ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx4Q91YJ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx4Q91YJ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx4Q91YJ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx4Q91YJ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx4Q91YJ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx4Q91YJ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx4Q91YJ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx4Q91YJ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx4Q91YJ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx4Q91YJ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx4Q91YJ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx4Q91YJ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx4Q91YJ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx4Q91YJ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx4Q91YJ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx4Q91YJ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx4Q91YJ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx4Q91YJ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx4Q91YJ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx4Q91YJ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx4Q91YJ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx4Q91YJ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms