RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	FLT1	P17948	1338 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	LAMB2	P55268	1798 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	TSPY2	A6NKD2	308 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	COQ9	O75208	318 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	INMT	O95050	263 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PLAU	P00749	431 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ITGA5	P08648	1049 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MAPK9	P45984	424 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF84	P51523	738 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PPAT	Q06203	517 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SPP2	Q13103	211 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PPIL2	Q13356	520 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP1A4	Q13733	1029 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	VGLL4	Q14135	290 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PTK2B	Q14289	1009 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	GRM4	Q14833	912 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ST3GAL2	Q16842	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	HYI	Q5T013	277 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	RFX6	Q8HWS3	928 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	NAXE	Q8NCW5	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	TRIM17	Q9Y577	477 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SCN4A	P35499	1836 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SNED1	Q8TER0	1413 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514		J3KRW8	73 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514		J3KTA2	159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PDHX	O00330	501 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CXCL11	O14625	94 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PCDH17	O14917	1159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	GPAA1	O43292	621 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	GH2	P01242	217 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PYGL	P06737	847 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	EGR1	P18146	543 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MCC	P23508	829 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	NDUFS1	P28331	727 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ADD2	P35612	726 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CASP2	P42575	452 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SOX2	P48431	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	RXRG	P48443	463 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	UBXN2A	P68543	259 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CCNA1	P78396	465 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SP3	Q02447	781 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MTA1	Q13330	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	STIM1	Q13586	685 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	RAB30	Q15771	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CCDC96	Q2M329	555 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	VSTM1	Q6UX27	236 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM71B	Q8TC56	605 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-218	ENST00000568514	MUL1	Q969V5	352 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms