RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd10Q6PE15 297 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb34Q7TNV8 81 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn3Q810P3 211 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il17reQ8BH06 637 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nod1Q8BHB0 953 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aph1bQ8C7N7 257 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItchQ8C863 864 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt13Q8JZU0 352 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r213Q8R278 384 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb19Q91Y01 801 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfap2dQ91ZK0 452 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npffr2Q924H0 417 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GsdmcQ99NB5 468 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo32Q9CPU7 355 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PiggD3Z3Y1 983 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp651E9PZ11 729 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp946F6VWU8 523 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akain1G3UWD5 69 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fignl2J3QK54 644 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc7O35250 697 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syngr1O55100 234 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il2P04351 169 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BpgmP15327 259 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfy2P20662 777 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MipP51180 263 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo39Q5NBU5 443 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn11Q60771 207 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfbp7Q61581 281 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh1a2Q62148 518 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Panx3Q8CEG0 392 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem82Q8R115 356 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha1Q91Y21 948 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vangl2Q91ZD4 521 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med21Q9CQ39 144 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CabyrQ9D424 453 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata1Q9D5R4 444 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a19Q9DAM5 318 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plin3Q9DBG5 437 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cul3Q9JLV5 768 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dach1Q9QYB2 751 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigqQ9QYT7 581 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shroom3Q9QXN0 1986 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr600E9PUN7 314 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01878 344 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CstaP56567 97 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adcy6Q01341 1165 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina6Q06770 397 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlipQ5FW52 269 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcna4Q61423 654 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde1aQ61481 565 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ProcrQ64695 242 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkqQ6P5E8 934 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rxfp1Q6R6I7 758 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr91Q7TMQ7 748 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baiap2l2Q80Y61 522 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb41Q811F1 908 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sik2Q8CFH6 931 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco4a1Q8K078 723 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PvrQ8K094 408 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SarafQ8R3Q0 334 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc30a1Q99J38 664 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lysmd3Q99LE3 305 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wars2Q9CYK1 360 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IcmtQ9EQK7 283 aa12.82□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tac1P41539 130 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NcanP55066 1268 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmb4P99026 264 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk7Q03147 346 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd11Q1RNF8 542 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gata6Q61169 589 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtl3Q6P1Y1 553 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sort1Q6PHU5 825 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap7Q7TN79 314 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syn3Q8JZP2 579 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actrt2Q9D9L5 377 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt7Q9DCV7 457 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc29a1Q9JIM1 460 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb2Q9QYI5 324 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubd1Q9R1K7 455 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC024978J3QPC3 361 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZfaP23607 742 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il12aP43431 215 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fut7Q11131 389 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam91a1Q3UVG3 837 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm5Q3UVX5 1203 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms