Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG5

Plin3, Perilipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plin3Q9DBG5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Plin3Q9DBG5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Plin3Q9DBG5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Plin3Q9DBG5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Plin3Q9DBG5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,7■■■□□ 2,66
Plin3Q9DBG5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Plin3Q9DBG5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Plin3Q9DBG5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Plin3Q9DBG5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Plin3Q9DBG5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Plin3Q9DBG5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Plin3Q9DBG5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Plin3Q9DBG5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Plin3Q9DBG5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Plin3Q9DBG5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Plin3Q9DBG5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Plin3Q9DBG5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Plin3Q9DBG5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Plin3Q9DBG5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Plin3Q9DBG5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Plin3Q9DBG5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Plin3Q9DBG5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Plin3Q9DBG5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Plin3Q9DBG5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Plin3Q9DBG5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Plin3Q9DBG5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Plin3Q9DBG5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Plin3Q9DBG5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Plin3Q9DBG5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,2
Plin3Q9DBG5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Plin3Q9DBG5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plin3Q9DBG5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plin3Q9DBG5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plin3Q9DBG5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plin3Q9DBG5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Plin3Q9DBG5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Plin3Q9DBG5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Plin3Q9DBG5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Plin3Q9DBG5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Plin3Q9DBG5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Plin3Q9DBG5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Plin3Q9DBG5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Plin3Q9DBG5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plin3Q9DBG5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Plin3Q9DBG5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plin3Q9DBG5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plin3Q9DBG5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plin3Q9DBG5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plin3Q9DBG5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plin3Q9DBG5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Plin3Q9DBG5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Plin3Q9DBG5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Plin3Q9DBG5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Plin3Q9DBG5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Plin3Q9DBG5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Plin3Q9DBG5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Plin3Q9DBG5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Plin3Q9DBG5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Plin3Q9DBG5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Plin3Q9DBG5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Plin3Q9DBG5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Plin3Q9DBG5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Plin3Q9DBG5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Plin3Q9DBG5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Plin3Q9DBG5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Plin3Q9DBG5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Plin3Q9DBG5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Plin3Q9DBG5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Plin3Q9DBG5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Plin3Q9DBG5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plin3Q9DBG5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Plin3Q9DBG5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Plin3Q9DBG5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Plin3Q9DBG5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Plin3Q9DBG5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Plin3Q9DBG5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Plin3Q9DBG5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Plin3Q9DBG5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Plin3Q9DBG5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Plin3Q9DBG5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Plin3Q9DBG5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Plin3Q9DBG5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Plin3Q9DBG5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Plin3Q9DBG5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Plin3Q9DBG5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Plin3Q9DBG5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Plin3Q9DBG5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Plin3Q9DBG5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Plin3Q9DBG5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Plin3Q9DBG5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Plin3Q9DBG5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Plin3Q9DBG5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Plin3Q9DBG5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Plin3Q9DBG5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Plin3Q9DBG5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Plin3Q9DBG5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Plin3Q9DBG5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Plin3Q9DBG5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Plin3Q9DBG5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Plin3Q9DBG5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms