Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Spata1Q9D5R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Spata1Q9D5R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Spata1Q9D5R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Spata1Q9D5R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Spata1Q9D5R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Spata1Q9D5R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Spata1Q9D5R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Spata1Q9D5R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Spata1Q9D5R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Spata1Q9D5R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Spata1Q9D5R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Spata1Q9D5R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Spata1Q9D5R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Spata1Q9D5R4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Spata1Q9D5R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Spata1Q9D5R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Spata1Q9D5R4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Spata1Q9D5R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Spata1Q9D5R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Spata1Q9D5R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Spata1Q9D5R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Spata1Q9D5R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Spata1Q9D5R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Spata1Q9D5R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Spata1Q9D5R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Spata1Q9D5R4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Spata1Q9D5R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Spata1Q9D5R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Spata1Q9D5R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Spata1Q9D5R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Spata1Q9D5R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Spata1Q9D5R4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Spata1Q9D5R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Spata1Q9D5R4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Spata1Q9D5R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Spata1Q9D5R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Spata1Q9D5R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Spata1Q9D5R4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Spata1Q9D5R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Spata1Q9D5R4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Spata1Q9D5R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Spata1Q9D5R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Spata1Q9D5R4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Spata1Q9D5R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Spata1Q9D5R4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Spata1Q9D5R4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Spata1Q9D5R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Spata1Q9D5R4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Spata1Q9D5R4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Spata1Q9D5R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Spata1Q9D5R4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Spata1Q9D5R4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Spata1Q9D5R4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Spata1Q9D5R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Spata1Q9D5R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Spata1Q9D5R4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Spata1Q9D5R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Spata1Q9D5R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Spata1Q9D5R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Spata1Q9D5R4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Spata1Q9D5R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,54■■■□□ 2
Spata1Q9D5R4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Spata1Q9D5R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Spata1Q9D5R4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Spata1Q9D5R4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Spata1Q9D5R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Spata1Q9D5R4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spata1Q9D5R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Spata1Q9D5R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Spata1Q9D5R4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Spata1Q9D5R4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,96
Spata1Q9D5R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Spata1Q9D5R4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Spata1Q9D5R4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Spata1Q9D5R4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spata1Q9D5R4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Spata1Q9D5R4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Spata1Q9D5R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Spata1Q9D5R4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Spata1Q9D5R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Spata1Q9D5R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Spata1Q9D5R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Spata1Q9D5R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Spata1Q9D5R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Spata1Q9D5R4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Spata1Q9D5R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Spata1Q9D5R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Spata1Q9D5R4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Spata1Q9D5R4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Spata1Q9D5R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Spata1Q9D5R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Spata1Q9D5R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
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